Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA

La resolución de rigor mortis muscular es producto de la acción de enzimas proteolíticas, del complejo calpaína/ calpastatina, que son las principales responsables de la terneza de las carnes. La proteína calpastatina (CAST), de 706 aminoácidos, se liga a los dominios III de la calpaína (CAPN) y dis...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autores principales: Jara, Leandro, De Biasio, María Bárbara, Sandoval, Gladis Lilia
Formato: Reunión
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad Nacional del Nordeste. Secretaría General de Ciencia y Técnica 2023
Materias:
Acceso en línea:http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/52921
Aporte de:
id I48-R184-123456789-52921
record_format dspace
institution Universidad Nacional del Nordeste
institution_str I-48
repository_str R-184
collection RIUNNE - Repositorio Institucional de la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE)
language Español
topic Terneza de carnes
Marcadores moleculares
Selección asistida de reproductores
spellingShingle Terneza de carnes
Marcadores moleculares
Selección asistida de reproductores
Jara, Leandro
De Biasio, María Bárbara
Sandoval, Gladis Lilia
Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
topic_facet Terneza de carnes
Marcadores moleculares
Selección asistida de reproductores
description La resolución de rigor mortis muscular es producto de la acción de enzimas proteolíticas, del complejo calpaína/ calpastatina, que son las principales responsables de la terneza de las carnes. La proteína calpastatina (CAST), de 706 aminoácidos, se liga a los dominios III de la calpaína (CAPN) y disminuye la actividad proteolítica de mu y mCAPN y consecuentemente la “tiernización” de la carne. Una actividad post-mortem aumentada de CAST correlaciona con terneza reducida de carnes. La actividad de la enzima está relacionada con la presencia de diferentes alelos en el genotipo del individuo. En bovinos se han descrito varios polimorfismos alélicos del tipo simple nucleótido (SNPs) en distintas regiones del gen (localizado en el cromosoma 7). Como parte de la selección asistida de reproductores, se analizan algunos SNPs, incluidos en test comerciales, por su significativa asociación con la variabilidad en terneza. Para determinar la frecuencia de las variantes alélicas de CAST en bovinos de carne del NEA se ensayaron múltiples reacciones de amplificación por PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) de regiones del gen que contienen los polimorfismos de interés seguido de digestión con enzimas de restricción para poner en evidencia los polimorfismos y conocer el estado de homo o heterocigosis. Se trabajó inicialmente con un polimorfismo de nucleótido único (SNP) en CAST descrito por Schenkel et al. 2005, transversión ó sustitución de G/C. Esta transversión en los productos de PCR resulta en la presencia/ausencia de un sitio de restricción para la enzima Rsa I, que reconoce la secuencia GT/AC (exón 5) en posición 257pb. El patrón de corte de la enzima permite conocer el genotipo en cada muestra: GG, GC o CC. Según Schenkel, el número de alelos C se relaciona con el porcentaje de inaceptabilidad de los bifes del músculo Longissimus (fuerza al corte de cizalla WB > 5.7 kg). Con las especificaciones técnicas de los autores y otras modificaciones ensayadas a esta técnica no se logró obtener el amplicón. Luego se probaron dos técnicas más, propuestas por Sakowski et al. (2008) - CAST-S - y por Curi et al (2009) -CAST-C, con resultados exitosos. Para CAST-S se obtuvieron fragmentos del gen de 624pb, amplicón que se sometió a restricción con la enzima Alu I a 37°C durante tres horas, para analizar el polimorfismo GC (identificado por Barendse en 2002, sustitución G/A en el extremo 3' no traducido del ARNm de CAST, posición 2959 de la secuencia GenBank AF117813). Para la PCR-RFLP de CAST-C (CAST 2959) se obtuvo un amplicón de 269 pb, que se sometió a restricción con la enzima Dde I, a 37°C cuatro horas, para analizar el polimorfismo A/G (GenBank AF159246). En ambos casos, los productos resultantes se analizaron por electroforesis en geles de agarosa teñida con bromuro de etidio y visualización por transiluminación UV. Las respectivas frecuencias para los alelos “tierno” y “duro” de CAST fueron respectivamente de 0,68 y 0,32 en Corrientes (C), de 0,59 y 0,41 en Chaco (Ch) para CAST-S (transversión C/G); de 0,72 y 0,27 en C y de 0,68 y 0,32 en Ch para CAST-C (transversión A/G). Así, hubo una mayor frecuencia de la variante polimórfica que resulta en la enzima menos activa (“carnes tiernas”) en los animales Braford de las poblaciones de los establecimientos analizados.
format Reunión
author Jara, Leandro
De Biasio, María Bárbara
Sandoval, Gladis Lilia
author_facet Jara, Leandro
De Biasio, María Bárbara
Sandoval, Gladis Lilia
author_sort Jara, Leandro
title Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
title_short Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
title_full Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
title_fullStr Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
title_full_unstemmed Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA
title_sort frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de calpastatina bovina en rodeos del nea
publisher Universidad Nacional del Nordeste. Secretaría General de Ciencia y Técnica
publishDate 2023
url http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/52921
work_keys_str_mv AT jaraleandro frecuenciadepolimorfismosdenucleotidosimpledecalpastatinabovinaenrodeosdelnea
AT debiasiomariabarbara frecuenciadepolimorfismosdenucleotidosimpledecalpastatinabovinaenrodeosdelnea
AT sandovalgladislilia frecuenciadepolimorfismosdenucleotidosimpledecalpastatinabovinaenrodeosdelnea
_version_ 1832345336019943424
spelling I48-R184-123456789-529212024-10-23T11:09:00Z Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA Jara, Leandro De Biasio, María Bárbara Sandoval, Gladis Lilia Terneza de carnes Marcadores moleculares Selección asistida de reproductores La resolución de rigor mortis muscular es producto de la acción de enzimas proteolíticas, del complejo calpaína/ calpastatina, que son las principales responsables de la terneza de las carnes. La proteína calpastatina (CAST), de 706 aminoácidos, se liga a los dominios III de la calpaína (CAPN) y disminuye la actividad proteolítica de mu y mCAPN y consecuentemente la “tiernización” de la carne. Una actividad post-mortem aumentada de CAST correlaciona con terneza reducida de carnes. La actividad de la enzima está relacionada con la presencia de diferentes alelos en el genotipo del individuo. En bovinos se han descrito varios polimorfismos alélicos del tipo simple nucleótido (SNPs) en distintas regiones del gen (localizado en el cromosoma 7). Como parte de la selección asistida de reproductores, se analizan algunos SNPs, incluidos en test comerciales, por su significativa asociación con la variabilidad en terneza. Para determinar la frecuencia de las variantes alélicas de CAST en bovinos de carne del NEA se ensayaron múltiples reacciones de amplificación por PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) de regiones del gen que contienen los polimorfismos de interés seguido de digestión con enzimas de restricción para poner en evidencia los polimorfismos y conocer el estado de homo o heterocigosis. Se trabajó inicialmente con un polimorfismo de nucleótido único (SNP) en CAST descrito por Schenkel et al. 2005, transversión ó sustitución de G/C. Esta transversión en los productos de PCR resulta en la presencia/ausencia de un sitio de restricción para la enzima Rsa I, que reconoce la secuencia GT/AC (exón 5) en posición 257pb. El patrón de corte de la enzima permite conocer el genotipo en cada muestra: GG, GC o CC. Según Schenkel, el número de alelos C se relaciona con el porcentaje de inaceptabilidad de los bifes del músculo Longissimus (fuerza al corte de cizalla WB > 5.7 kg). Con las especificaciones técnicas de los autores y otras modificaciones ensayadas a esta técnica no se logró obtener el amplicón. Luego se probaron dos técnicas más, propuestas por Sakowski et al. (2008) - CAST-S - y por Curi et al (2009) -CAST-C, con resultados exitosos. Para CAST-S se obtuvieron fragmentos del gen de 624pb, amplicón que se sometió a restricción con la enzima Alu I a 37°C durante tres horas, para analizar el polimorfismo GC (identificado por Barendse en 2002, sustitución G/A en el extremo 3' no traducido del ARNm de CAST, posición 2959 de la secuencia GenBank AF117813). Para la PCR-RFLP de CAST-C (CAST 2959) se obtuvo un amplicón de 269 pb, que se sometió a restricción con la enzima Dde I, a 37°C cuatro horas, para analizar el polimorfismo A/G (GenBank AF159246). En ambos casos, los productos resultantes se analizaron por electroforesis en geles de agarosa teñida con bromuro de etidio y visualización por transiluminación UV. Las respectivas frecuencias para los alelos “tierno” y “duro” de CAST fueron respectivamente de 0,68 y 0,32 en Corrientes (C), de 0,59 y 0,41 en Chaco (Ch) para CAST-S (transversión C/G); de 0,72 y 0,27 en C y de 0,68 y 0,32 en Ch para CAST-C (transversión A/G). Así, hubo una mayor frecuencia de la variante polimórfica que resulta en la enzima menos activa (“carnes tiernas”) en los animales Braford de las poblaciones de los establecimientos analizados. 2023-11-08T12:26:24Z 2023-11-08T12:26:24Z 2013 Reunión Jara, Leandro, De Biasio, María Bárbara y Sandoval, Gladis Lilia, 2013. Frecuencia de polimorfismos de nucleótido simple de Calpastatina bovina en rodeos del NEA. En: XIX Reunión de Comunicaciones Científicas y Tecnologías Edición 2013. Corrientes: Universidad Nacional del Nordeste. Secretaría General de Ciencia y Técnica, p. 1-1. http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/52921 spa UNNE/PI/17B144/AR. Corrientes/Gen de terneza de la carne bovina: polimorfismos existentes en reproductores para rodeos de carne en el nordeste argentino. Período 2009-2012 openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ application/pdf p. 1-1 application/pdf Universidad Nacional del Nordeste. Secretaría General de Ciencia y Técnica