La proteína ASR1 de tomate : aspectos estructurales y funcionales : búsqueda de sus genes blanco

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Las proteínas ASR, exclusivas del reino vegetal, se encuentran relacionadas con la respuesta al estrés por falta de agua y otros estreses. ASR1 tiene funciones de chaperona y factor de transcripción. Esta función dual de ASR1 se condice con su presencia en extractos citosólicos y nucleares. Hemos co...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor principal: Ricardi, Martiniano María
Otros Autores: Iusem, Norberto Daniel
Formato: Tesis doctoral publishedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2012
Materias:
ASR1
ESTRES
CHIP
GENES REGULADOS
TOMATE
STRESS
REGULATED GENES
TOMATO
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5285_Ricardi
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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spelling tesis:tesis_n5285_Ricardi2025-03-31T21:33:43Z La proteína ASR1 de tomate : aspectos estructurales y funcionales : búsqueda de sus genes blanco tomato ASR1 protein : functional and structural aspects : search for its target genes Ricardi, Martiniano María Iusem, Norberto Daniel ASR1 ESTRES CHIP GENES REGULADOS TOMATE ASR1 STRESS CHIP REGULATED GENES TOMATO Las proteínas ASR, exclusivas del reino vegetal, se encuentran relacionadas con la respuesta al estrés por falta de agua y otros estreses. ASR1 tiene funciones de chaperona y factor de transcripción. Esta función dual de ASR1 se condice con su presencia en extractos citosólicos y nucleares. Hemos corroborado in planta esta localización dual y demostrando que la misma ocurre por difusión y no mediante transporte activo. Además demostramos que dicha proteína puede homodimerizar en el citosol y se encuentra como dímero en el núcleo. Por otra parte, hemos adaptado exitosamente una metodología de inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP) para tomate. Este protocolo fue utilizado para realizar un ChIP “semi-nativo” y detectar marcas de histonas relacionadas a represión y activación de genes en todo el genoma de tomate a lo largo de diferentes estadíos de maduración del fruto. Además, experimentos de ChIP sobre hojas de plantas de tomate estresadas, usando un anticuerpo anti-ASR1, mostraron que la mayoría de las regiones genómicas se ubicaron cerca de genes. Los grupos de genes hallados, y por lo tanto posiblemente regulados por ASR1, están relacionados a la síntesis y remodelación de la pared celular, y al transporte de agua y solutos. Finalmente, encontramos una robusta secuencia de ADN consenso de "binding" para ASR1. ASR proteins, exclusive to the plant kingdom, are related to water stress and other abiotic stresses. ASR1 has chaperone and transcription factor functions. This dual function is correlated with a dual nuclear/cytosolic subcellular localization, demonstrated to be due to diffusion rather than active transport. Additionally, we observed homodimerization in cytosol and homodimers in the nucleus. We have also successfully adapted a chromatin immunoprecipitation protocol (ChIP) for tomato. This protocol was used to perform semi-native ChIP for detection of repressive and activating histone modifications genome wide at different fruit maturation stages. In addition, ChIP assays on leaves from stressed tomato plants, performed with an anti-ASR1 antibody, showed that most of the enriched genomic regions were located near genes. The gene groups found, and hence probably regulated by ASR1, were related to cell wall synthesis and remodeling, and water and solute transport. Finally, we were able to find a robust consensus ASR1-binding DNA sequence. Fil: Ricardi, Martiniano María. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2012 info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf spa info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5285_Ricardi
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