Desarrollo de un mapa genético y físico integrado para girasol cultivado y su aplicación en la caracterización de regiones genómicas involucradas en la resistencia a enfermedades

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En el presente trabajo se describe la construcción de un mapa genético saturado de referencia para girasol (Helianthus annuus) y la localización física de grupos de ligamiento que incluyen genes y/o regiones genómicas de interés agronómico. Se obtuvo un mapa genético a partir de una población de lín...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor principal: Talia, Paola M.
Otros Autores: Heinz, Ruth
Formato: Tesis doctoral publishedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2008
Materias:
HELIANTHUS ANNUUS
SSR
EST-SSR
MAPA GENETICO
MAPA FISICO
CARIOTIPO
BAC-FISH
PRINS
GENETIC MAP
PHYSICAL MAP
KARYOTYPE
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4384_Talia
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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spelling tesis:tesis_n4384_Talia2025-03-31T21:26:32Z Desarrollo de un mapa genético y físico integrado para girasol cultivado y su aplicación en la caracterización de regiones genómicas involucradas en la resistencia a enfermedades Development of an integrated genetic and physical map for cultivated sunflower and its application in the characterization of genomic regions involved in disease resistance Talia, Paola M. Heinz, Ruth Paniego, Norma HELIANTHUS ANNUUS SSR EST-SSR MAPA GENETICO MAPA FISICO CARIOTIPO BAC-FISH PRINS HELIANTHUS ANNUUS SSR EST-SSR GENETIC MAP PHYSICAL MAP KARYOTYPE BAC-FISH PRINS En el presente trabajo se describe la construcción de un mapa genético saturado de referencia para girasol (Helianthus annuus) y la localización física de grupos de ligamiento que incluyen genes y/o regiones genómicas de interés agronómico. Se obtuvo un mapa genético a partir de una población de líneas recombinantes endocriadas (RILs) derivadas del cruzamiento de RHA266 x PAC2 que incluye 547 marcadores (231 SSR, 9 EST-SSR, 3 InDels y 304 AFLPs ordenados en 17 grupos de ligamiento (GL) con un valor LOD de 4. La longitud total estimada del mapa genético es de 1.942,3 cM con una densidad media de 3,6 cM por locus. La incorporación de SSRs permitió relacionar el mapa con otros mapas públicos unificando la nomenclatura para la denominación de los GLs. Se caracterizó el complemento cromosómico de H annuus mediante el mapeo físico de regiones repetitivas propias de la especie utilizando la técnica BAC-FISH. Se localizaron físicamente marcadores SSR ubicados en los GL 10 y 16 usando la técnica BAC-FISH y marcadores anclados en los GL 7 y 17 mediante C-PRINS. Los GL 10, 16 y 17 fueron seleccionados en base a su asociación con QTLs de resistencia a Sclerotinia sclerotiorum y el GL 7 por su asociación con QTLs de tolerancia a estrés hídrico. La integración de estrategias basadas en mapas genéticos saturados, mapas físicos y genómica comparativa permite expandir los alcances de la investigación hacia el análisis de QTLs, el clonado posicional de genes, y el mapeo físico de regiones de interés agronómico. This work presents the construction of a reference saturated-genetic-linkage-map form cultivated sunflower (Helianthus annuus) and the physical localization of linkage groups that include genes or genomic regions of agricultural interest. The reference genetic map was obtained using a recombinant inbred line (RIL) mapping population generated from the cross between (RHA266 x PAC2). It consisted of 547 markers (231 SSR, 9 EST-SSR, 3 InDels and 304 AFLPs) distributed in 17 linkage groups (LG), with a LOD score of 4. The map spanned 1942.3 centimorgans (cM) and had a mean density of 3.6 cM per locus. The incorporation of SSR allowed the complete cross reference with the public maps, unifying the nomenclature for the LGs. Sunflower chromosome complement was characterized using the BAC-FISH technique. Physical mapping of SSR of the LGs 10 and 16 was accomplished using BAC-FISH procedure and SSR of LGs 7 and 17 were localized by the C-PRINS technique. LGs 10, 16 and 17 were selected based on their association with QTLs for resistance to Sclerotinia sclerotiorum and LG 7 based on its association with QTLs for tolerance to water stress. The integration of saturated genetic maps, physical map, and comparative genomics approaches will allow expanding the scope of the present research to the analysis of QTLs, map-based gene cloning, and the physical mapping of agricultural important regions. Fil: Talia, Paola M.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2008 info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf spa info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4384_Talia
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