Amplificación interespecífica de microsatélites de Astyanax abramis, utilizando cebadores para la especie emparentada Astyanax fasciatus

Fil: Ojeda, Alejandra Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones "María Ebe Reca"; Argentina.

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Ojeda, Alejandra Paola, Hirt, Lourdes M., Zapata, Pedro Darío
Formato: Artículo publishedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Secretaría de Investigación y Posgrado 2012
Materias:
Astyanax abramis
SSR
Amplificación interespecífica
Cross-amplification
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12219/6050
Aporte de:
Repositorio Institucional Digital de la UNaM (RIDUNAM) de Universidad Nacional de Misiones
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spelling I77-R195-20.500.12219-60502025-12-05T11:29:05Z Amplificación interespecífica de microsatélites de Astyanax abramis, utilizando cebadores para la especie emparentada Astyanax fasciatus Interspecific amplification de Astyanax abramis microsatellites using primers for the related astyanax fasciatus Ojeda, Alejandra Paola Hirt, Lourdes M. Zapata, Pedro Darío Astyanax abramis SSR Amplificación interespecífica Cross-amplification Fil: Ojeda, Alejandra Paola. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones "María Ebe Reca"; Argentina. Fil: Hirt, Lourdes M. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología General; Argentina. Fil: Zapata, Pedro Darío. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología Misiones "María Ebe Reca"; Argentina. La reserva de la Biosfera Yabotí se localiza en el centro-este de la Provincia de Misiones (Argentina) y cubre un amplio sector que comprende el arrojo Yabotí y sus efluentes. Astyanax es un importante eslabón en la cadena trófica y en el mantenimiento de las comunidades ícticas naturales. Los estudios poblacionales son datos ecológicos que permiten el análisis sobre el manejo sustentable del recurso y las regiones microsatélites representan marcadores de gran utilidad en este sentido. Sin embargo aún no existen datos genómicos de estas regiones en esta especie, siendo conocidos únicamente SSR para la especie emparentada Astyanax fasciatus. El objetivo de este trabajo fue lograr la amplificación interespecífica de regiones de microsatélites en Astyanax abramis utilizando cebadores diseñados para A. fasciatus. Se extrajo DNA de tejido muscular del pedúnculo caudal de 13 individuos. Se estandarizaron las condiciones para amplificar 4 regiones microsatélites en A. abramis: Abra1, Abra2, Abra3 y Abra4, de los cuales 3 fueron secuenciados y registrados en Genebank. Nuestros hallazgos confirman la transferibilidad de los cebadores utilizados, reconociendo secuencias conservadas y permitiendo establecer las primeras secuencias microsatélites de la especie estudiada. The Yabotí biosphere reserve is located in the center-east of Misiones (Argentina) and it covers a vast area of the basins of Yabotí streams, tributaries of Alto Uruguay River. Astyanax is important in the trophic level and in the maintenance of the natural fish communities, since it is food for the last links of the food chain. Population analysis are important ecological data for supporting the reasonable use of the resource. Futhermore, there are no yet specific data for SSR regions in Astyanax abramis, only for Astyanax fasciatus. The objective of this work was to cross-amplify the microsatellites regions of in Astyanax abramis with specific primers designed for A. fasciatus. DNA was extracted from the caudal fin peduncle from 13 specimens. The PCR conditions were standardized to extend 3 microsatellite regions in A. abramis: Abra1, Abra2, Abra3 y Abra4. Three of these were sequenced and registered in the Genebank database. Although our findings are preliminary, they confirm the transferability of the use of primers, identifying sequences preserved and allowing us to establish the first microsatellite sequence of the species under study. 2012-06-30 info:eu-repo/semantics/article info:ar-repo/semantics/artículo info:eu-repo/semantics/publishedVersion https://hdl.handle.net/20.500.12219/6050 spa info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://www.fceqyn.unam.edu.ar/recyt/index.php/recyt/article/view/479/400 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://www.redalyc.org/pdf/3826/382679028007.pdf info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://www.scielo.org.ar/pdf/recyt/n17/n17a07.pdf info:eu-repo/semantics/altIdentifier/urn/https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=10393911 info:eu-repo/semantics/openAccess application/pdf application/pdf 702 KB Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Secretaría de Investigación y Posgrado

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