Aplicación de marcadores moleculares a estudios de variabilidad genética en poáceas forrajeras templadas

En la Argentina, alrededor de 22 especies Poáceas son utilizadas, en diferentes sistemas de producción de la región templada, para la alimentación del ganado en forma directa o diferida como heno. Se adaptan a crecer solas o en mezclas con otras especies Poáceas o Fabáceas y en diferentes condicione...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Cuyeu, Alba Romina
Otros Autores: Ríos, Raúl D.
Formato: Tesis doctoral acceptedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad Nacional de Luján 2008
Materias:
Forrajes
Ecología
Acceso en línea:http://ri.unlu.edu.ar/xmlui/handle/rediunlu/351
Aporte de:
REDIUNLu - Repositorio Digital Institucional de Acceso Abierto - Universidad Nacional de Luján (UNLu) de Universidad Nacional de Luján (UNLu)
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description En la Argentina, alrededor de 22 especies Poáceas son utilizadas, en diferentes sistemas de producción de la región templada, para la alimentación del ganado en forma directa o diferida como heno. Se adaptan a crecer solas o en mezclas con otras especies Poáceas o Fabáceas y en diferentes condiciones de suelo destacándose su aporte para mejorar la estructura, mantener la fertilidad y controlar la erosión de los suelos. La festuca alta (Festuca arundinacea Schreb) y la cebadilla criolla (Bromus catharticus VahIJ están entre las forrajeras templadas mas importantes y utilizadas en Argentina. El objetivo de este trabajo fue caracterizar, mediante marcadores moleculares SSR, la variabilidad genética de las colecciones de festuca alta y cebadilla criolla del Banco de Activo de Germoplasma de la EEA INTA Pergamino, y comparar la estructura genética de las accesiones de ambas especies. Para ello, se analizaron 161 accesiones de festuca alta y 68 accesiones de cebadilla criolla, trabajadas en bulk. El sistema de PCR usado se basó en marcadores SSR marcados con fluorescencia y la detección de los fragmentos amplificados se realizó en el Analizador Genético ABI 3130. En festuca alta, a partir de una evaluación de 45 SSR, se seleccionaron 15 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. En cebadilla criolla, luego de una evaluación de 134 SSR de otras poáceas, se transfirieron 26 SSR, seleccionándose 17 SSR por criterio de calidad de amplificación y de detección de polimorfismo. Los datos generados por los marcadores moleculares se codificaron en forma binaria: presencia/ ausencia de banda y ¡as distancias genéticas fueron estimadas a partir del coeficiente de similitud Dice (festuca) o Jaccard (cebadilla). Los agrupamientos se determinaron por el método de promedio aritmético de grupos de pares no ponderados (UPGMA) y las relaciones genéticas entre las accesiones se visualizaron mediante dendogramas. En festuca alta la caracterización de las 161 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,22 y 0,76, confirmando la existencia de elevada variabilidad genética entre las mismas. Además, la caracterización individual de 22 accesiones representativas de los agrupamientos observados mostró que el 71% de la variabilidad molecular se encuentra dentro de las accesiones y el 29% entre las mismas. A pesar de ello, la caracterización de esas mismas accesiones en bulk proveyó una adecuada caracterización de las mismas. En cebadilla criolla, la caracterización de las 68 accesiones mostró una distancia genética que varió entre 0,10 y 0,60 confirmando la existencia de una moderada variabilidad genética entre las mismas. Cabe destacar que dicha variabilidad está relacionada al origen geográfico de las accesiones verificándose una interesante diferenciación de aquellas provenientes del Oeste de la región muestreada. Por otra parte la comparación, para un subconjunto de las accesiones, de las relaciones genéticas obtenidas mediante RAPD y SSR mostró agrupamientos similares aunque la capacidad discriminatoria de los SSR fue superior. Se verificó para ambas especies la ausencia de accesiones duplicadas.
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