Estudio de los profagos de Streptococcus agalactiae y sus lisinas. Aportes a la epidemiología. Posible uso en la prevención y tratamiento de las infecciones en neonatos, mujeres embarazadas y adultos

Fil: Kovacec, Verónica Ivana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina

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Detalles Bibliográficos
Autor principal:	Kovacec, Verónica Ivana
Otros Autores:	Bonofiglio, Laura
Formato:	Tesis doctoral acceptedVersion
Lenguaje:	Español
Publicado:	Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica 2024
Materias:	Streptococcus agalactiae Estreptococo del grupo B EGB Bacteriófago Profago Argentina Análisis genómico Tipificación fágica Lisina Epidemiología Ciencias de la vida
Acceso en línea:	http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_7954 https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_7954.dir/7954.PDF
Aporte de:	Repositorio Digital de la Universidad de Buenos Aires (UBA) de Universidad de Buenos Aires

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Los profagos pueden contribuir a la diversidad bacteriana, la adaptación al ambiente, patogenicidad y pueden propiciar la transferencia horizontal de genes entre bacterias. El rol de los profagos en la epidemiología de EGB se encuentra en estudio. Se postula que el aumento de las infecciones por EGB estaría vinculado a la adquisición de ciertos profagos. A la fecha no hay datos sobre el contenido de profagos en EGB circulantes en Sudamérica.\nLas lisinas fágicas degradan el peptidoglicano de la pared bacteriana, provocando la lisis celular al final del ciclo de infección del fago. Se ha demostrado que las lisinas aplicadas de forma exógena lisan bacterias Gram positivas.\nEsta tesis cuenta con dos objetivos generales: 1) contribuir al conocimiento de la biología de los profagos de EGB y su posible rol en la epidemiología de los aislamientos circulantes en Argentina; 2) contribuir al estudio de lisinas fágicas para su aplicación futura en la descolonización vaginal de mujeres embarazadas y el tratamiento de infecciones por EGB.\nEn esta tesis se caracterizaron los genomas completos y profagos de 468 aislamientos de EGB provenientes de diferentes sitios de infección o colonización en humanos. De todos los EGB analizados, 365 fueron obtenidos a partir de un estudio multicéntrico argentino realizado por nuestro grupo de trabajo, mientras que 103 genomas fueron obtenidos de bases de datos públicas y corresponden a distintas localizaciones geográficas. El contenido de profagos fue analizado en el contexto de las características epidemiológicas y genómicas de EGB. Para la detección y clasificación de profagos se utilizaron dos métodos propuestos en bibliografía: búsqueda por PCR (aplicada in silico) de genes específicos de 6 grupos profágicos y búsqueda mediante blastx de 16 tipos de integrasa fágica. Como parte de esta tesis se propusieron dos modificaciones al sistema de clasificación: 1) clasificar por tipo profágico (integrando grupo profágico y tipo de integrasa), para mejorar la representación de la diversidad de profagos; 2) actualizar los genes específicos de grupo profágico, para disminuir los falsos positivos y negativos, y realizar su búsqueda con blastn (en vez de PCR), para simplificar la metodología.\nSe caracterizaron las lisinas profágicas, lo que permitió la selección de una de cada clase, según sitio de clivaje del peptidoglicano, para su clonado, producción, evaluación preliminar de actividad enzimática y purificación.\nLos resultados obtenidos revelaron que los aislamientos argentinos se encuentran relacionados con EGB distribuidos globalmente. Se hallaron hasta 4 profagos en 74% de los genomas. La cantidad y tipo de profagos difirió según complejo clonal y serotipo, encontrándose la mayor cantidad de profagos por cepa en los linajes hipervirulentos CC17/III y CC19/III. La utilización de la metodología propuesta en esta tesis permitió la clasificación de la totalidad de los profagos (en contraste con el 80% clasificado por la metodología previa) y detectó 2 nuevos tipos de integrasa. En total se encontraron 29 tipos profágicos, todos codificantes de proteínas relacionadas a fitness bacteriano, mecanismos de defensa y/o virulencia y, en un profago, a resistencia antimicrobiana. El análisis comparativo de los profagos reveló homología entre los genes codificantes de la cola en varios grupos profágicos, mientras que los módulos de lisogenia y replicación fueron los que presentaron mayores diferencias entre cada tipo profágico. Se encontró relación entre profagos de EGB y de otras 24 especies de Estreptococos.\nLas lisinas fueron clasificadas en 3 clases según su sitio de clivaje del peptidoglicano. Se clonó y expresó una lisina de cada clase y, en ensayos preliminares, se observó actividad enzimática contra EGB de los serotipos prevalentes en 2 de ellas. Dos de las tres lisinas fueron purificadas por cromatografía de intercambio aniónico.\nEste es el primer reporte de la diversidad de profagos en EGB aislados de humanos en Latinoamérica. La presencia de profagos en la mayoría de los genomas, la diferente distribución de los mismos en los diversos linajes de EGB y su contenido de genes beneficiosos para la bacteria hospedera refuerzan la hipótesis de que la presencia de profagos confiere una ventaja evolutiva a esta especie bacteriana y puede impactar en su epidemiología. La metodología propuesta en esta tesis para la búsqueda de profagos permite la rápida detección de una amplia variedad de profagos en una gran colección de genomas de EGB y su clasificación basada tanto en el linaje filogenético (grupo profágico) como en el sitio de inserción del fago (tipo de integrasa). Las lisinas encontradas podrían ser usadas contra la diversidad de cepas de EGB.\nEn el contexto global de multirresistencia bacteriana a los antibióticos, es imperativo avanzar en la generación de conocimiento sobre la biología de los fagos y de las lisinas para impulsar y contribuir a la aprobación y regulación de terapias con estos agentes en el menor plazo posible. application/pdf Torres, Carolina Piuri, Mariana Sanso, Mariel Streptococcus agalactiae Estreptococo del grupo B EGB Bacteriófago Profago Argentina Análisis genómico Tipificación fágica Lisina Epidemiología spa Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ Ciencias de la vida Doctora de la Universidad de Buenos Aires en Ciencias de la Salud Estudio de los profagos de Streptococcus agalactiae y sus lisinas. Aportes a la epidemiología. Posible uso en la prevención y tratamiento de las infecciones en neonatos, mujeres embarazadas y adultos info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/acceptedVersion http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_7954 https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_7954.dir/7954.PDF

Estudio de los profagos de Streptococcus agalactiae y sus lisinas. Aportes a la epidemiología. Posible uso en la prevención y tratamiento de las infecciones en neonatos, mujeres embarazadas y adultos

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