Aplicaciones catalíticas de oligonucleótidos modificados

Oligonucleotides whose function is associated with catalytic or molecular recognition processes\nare known as functional oligonucleotides (ribozymes, DNAzymes, aptamers) and their applications\ninclude gene silencing therapy, diagnostic tools and sensor development, biocatalysis and\nnanotechnology....

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Autor principal: Dellafiore, María Andrea
Otros Autores: Iribarren, Adolfo M.
Formato: Tesis doctoral acceptedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Facultad de Farmacia y Bioquímica 2017
Materias:
Acceso en línea:http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_2108
http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_2108.dir/2108.PDF
Aporte de:
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spelling I28-R145-HWA_21082019-09-25 Oligonucleotides whose function is associated with catalytic or molecular recognition processes\nare known as functional oligonucleotides (ribozymes, DNAzymes, aptamers) and their applications\ninclude gene silencing therapy, diagnostic tools and sensor development, biocatalysis and\nnanotechnology.\nIn this work, we studied how to optimize the use of these oligonucleotides by incorporating\nchemical modifications.\nInitially, we studied the modulating effect of 2'-deoxy-2'-C-methylpyrimidin nucleosides on:\nthe hydrolytic activity and stability in biological media of 8-17 DNAzyme when incorporated in\ndifferent positions of their catalytic core; the silencing potency and specificity of siRNAs when\nincorporated in different positions of the antisense and sense strands; the thermodynamic stability\nof duplex and i-motif-forming DNA.\nFinally, the study was extended to the peroxidase DNAzyme using a fully modified sequence\nwith L-nucleotides and also an immobilized sequence testing a wide repertoire of substrates,\nincluding sulfides and paracetamol. Fil: Dellafiore, María Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina Iribarren, Adolfo M. Moglioni, Albertina Facultad de Farmacia y Bioquímica Montserrat, Javier M. Dellafiore, María Andrea 2017-11-02 Los oligonucleótidos cuya función se encuentra asociada a procesos catalíticos o de\nreconocimiento molecular se los conoce como oligonucleótidos funcionales (ribozimas, DNAzimas,\naptámeros) y sus aplicaciones abarcan el silenciamiento génico, el desarrollo de herramientas de\ndiagnóstico y sensores, la biocatálisis y la nanotecnología.\nEn este trabajo se estudió cómo optimizar el uso de estos oligonucleótidos mediante la\nincorporación de modificaciones químicas.\nInicialmente, se estudió el efecto modulador de 2?-desoxi-2?-C-metilpirimidín nucleósidos\nsobre: la actividad hidrolítica y estabilidad en medios biológicos de la DNAzima 8-17 al ser\nincorporados en distintas posiciones de su núcleo catalítico; la potencia silenciadora y la\nespecificidad de siRNAs al ser incorporados en distintas posiciones de las cadenas antisentido y\nsentido; la estabilidad termodinámica de oligonucleótidos de ADN formadores de dúplex e i-motif.\nPor último, se amplió el estudio a la DNAzima peroxidasa utilizando el oligonucleótido\nmodificado en su totalidad con L-nucleótidos y el oligonucleótido inmovilizado, empleando un\namplio repertorio de sustratos, entre ellos sulfuros y paracetamol. application/pdf Orelli, Liliana Postigo, José Furlong, Jorge Oligonucleótidos funcionales 2'-desoxi-2'-C-metilpirimidin nucleósidos DNAzima Aptámero DNAzima 8-17 DNAzima peroxidasa siRNA i-motif Functional oligonucleotides 2'-deoxy-2'-C-methylpyrimidin nucleosides DNAzyme Aptamer 8-17 DNAzyme Peroxidase DNAzyme siRNA i-motif spa Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ Ciencia de la vida Aplicaciones catalíticas de oligonucleótidos modificados info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/acceptedVersion http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_2108 http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_2108.dir/2108.PDF
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description Oligonucleotides whose function is associated with catalytic or molecular recognition processes\nare known as functional oligonucleotides (ribozymes, DNAzymes, aptamers) and their applications\ninclude gene silencing therapy, diagnostic tools and sensor development, biocatalysis and\nnanotechnology.\nIn this work, we studied how to optimize the use of these oligonucleotides by incorporating\nchemical modifications.\nInitially, we studied the modulating effect of 2'-deoxy-2'-C-methylpyrimidin nucleosides on:\nthe hydrolytic activity and stability in biological media of 8-17 DNAzyme when incorporated in\ndifferent positions of their catalytic core; the silencing potency and specificity of siRNAs when\nincorporated in different positions of the antisense and sense strands; the thermodynamic stability\nof duplex and i-motif-forming DNA.\nFinally, the study was extended to the peroxidase DNAzyme using a fully modified sequence\nwith L-nucleotides and also an immobilized sequence testing a wide repertoire of substrates,\nincluding sulfides and paracetamol.
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