Assessment of the genetic structure of two different tomato breeding populations by Principal Component Analysis
No Melhoramento de Plantas, diferentes populações são geradas e frequentemente representam diferentes arranjos de genes de um pool genético comum selecionado. A técnica de Análise de Componentes Principais (PCA) tem sido amplamente aplicada para avaliar a estrutura genética de diferentes populações....
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Universidad Nacional del Litoral
2024
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No Melhoramento de Plantas, diferentes populações são geradas e frequentemente representam diferentes arranjos de genes de um pool genético comum selecionado. A técnica de Análise de Componentes Principais (PCA) tem sido amplamente aplicada para avaliar a estrutura genética de diferentes populações. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o PCA para avaliar a estrutura genética de duas populações de tomate reprodutores, uma representando a etapa final de um programa de melhoramento (população RIL) e a outra, uma etapa inicial (uma população de seis gerações básicas, composta por dois genitores homozigotos, seu F1 heterozigoto e o F2 segregante e dois retrocruzamentos). Ambas as populações foram avaliadas quanto a características quantitativas fenotípicas e a estrutura da população foi avaliada em termos de variâncias e covariâncias. O PCA foi adequado para avaliar as diferenças na estrutura genética para as características de qualidade dos frutos avaliadas em ambas as populações. |
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I26-R133-article-129212024-07-04T18:21:56Z Assessment of the genetic structure of two different tomato breeding populations by Principal Component Analysis Evaluación de la estructura genética de dos poblaciones de mejoramiento diferentes de tomate mediante Análisis de Componentes Principales Vitelleschi, María Susana Pratta, Guillermo Raul tomato fruit quality Classical Quantitative Genetics Plant Genetic Resources Multivariate Statistics Techniques calidad del fruto Genética Cuantitativa Clásica Recursos Fitogenéticos Técnicas Estadísticas Multivariadas calidad del fruto Genética Cuantitativa Clásica Recursos Fitogenéticos Técnicas Estadísticas Multivariadas No Melhoramento de Plantas, diferentes populações são geradas e frequentemente representam diferentes arranjos de genes de um pool genético comum selecionado. A técnica de Análise de Componentes Principais (PCA) tem sido amplamente aplicada para avaliar a estrutura genética de diferentes populações. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o PCA para avaliar a estrutura genética de duas populações de tomate reprodutores, uma representando a etapa final de um programa de melhoramento (população RIL) e a outra, uma etapa inicial (uma população de seis gerações básicas, composta por dois genitores homozigotos, seu F1 heterozigoto e o F2 segregante e dois retrocruzamentos). Ambas as populações foram avaliadas quanto a características quantitativas fenotípicas e a estrutura da população foi avaliada em termos de variâncias e covariâncias. O PCA foi adequado para avaliar as diferenças na estrutura genética para as características de qualidade dos frutos avaliadas em ambas as populações. In Plant Breeding, different populations are generated, which frequently represent different gene arrangement from a common selected gene pool. The technique of Principal Component Analysis (PCA) has been widely applied to evaluate the genetic structure of different populations. The objective of this research was to assess PCA for evaluating the genetic structure of two breeding tomato populations, one representing a final step of a breeding program (RIL population) and the other, an initial step (a six basic generations’ population, composed by two homozygous parent, their heterozygous F1 and the segregating F2 and two backcrosses). Both populations were evaluated for phenotypic quantitative traits and population structure was assessed in terms of variances and covariances. PCA was adequate for evaluating differences in genetic structure for evaluated fruit quality traits in both populations. En el fitomejoramiento, se generan diferentes poblaciones que con frecuencia representan diferentes arreglos genéticos de un acervo genético común seleccionado. La técnica de Análisis de Componentes Principales (PCA) ha sido ampliamente aplicada para evaluar la estructura genética de diferentes poblaciones. El objetivo de esta investigación fue aplicar PCA para evaluar la estructura genética de dos poblaciones de tomate de mejoramiento, una que representa un paso final de un programa de mejoramiento (población de RIL) y otra, un paso inicial (una población de seis generaciones básicas, compuesta por dos progenitores homocigotos y, su F1 heterocigota como materiales genéticamente uniformes y las generaciones segrgenates F2 y las dos retrocruzas). Ambas poblaciones fueron evaluadas para rasgos cuantitativos fenotípicos y la estructura de la población fue evaluada en términos de varianzas y covarianzas. La técnica de PCA fue adecuado para evaluar las diferencias en la estructura genética de los rasgos de calidad de la fruta evaluados en ambas poblaciones. Universidad Nacional del Litoral 2024-07-04 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf application/zip text/html https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEAgrarias/article/view/12921 10.14409/fa.2024.23.e0024 FAVE Sección Ciencias Agrarias; Núm. 23 (2024): FAVE Sección Ciencias Agrarias ; e0024 FAVE Sección Ciencias Agrarias; No. 23 (2024): https://drive.google.com/drive/folders/13lK25v9bqwuomgNliprcpw-qJw9W_Uwk?usp=drive_link; e0024 FAVE Sección Ciencias Agrarias; n. 23 (2024): FAVE Sección Ciencias Agrarias ; e0024 2346-9129 1666-7719 10.14409/fa.2024.23 spa https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEAgrarias/article/view/12921/19103 https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEAgrarias/article/view/12921/19104 https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEAgrarias/article/view/12921/19105 Derechos de autor 2024 FAVE Sección Ciencias Agrarias https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0 |