Estudio de la capacidad de biodegradación de hidrocarburos en los sedimentos marinos de la costa patagónica
Los hidrocarburos constituyen una de las principales amenazas para el ecosistema costero de la Patagonia. A pesar de ello, aún existe un gran desconocimiento sobre cuáles son los microorganismos que poseen el potencial para degradar hidrocarburos en este ambiente. Esta Tesis fue desarrollada con...
| Autor principal: | |
|---|---|
| Otros Autores: | |
| Formato: | tesis doctoral |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2013
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://repositoriodigital.uns.edu.ar/handle/123456789/50 |
| Aporte de: |
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Biología Hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs) Biodegradación Sedimentos costeros intermareales Patagonia (Argentina) |
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Biología Hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs) Biodegradación Sedimentos costeros intermareales Patagonia (Argentina) Marcos, Magalí S. Estudio de la capacidad de biodegradación de hidrocarburos en los sedimentos marinos de la costa patagónica |
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Biología Hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs) Biodegradación Sedimentos costeros intermareales Patagonia (Argentina) |
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Los hidrocarburos constituyen una de las principales amenazas para el ecosistema costero
de la Patagonia. A pesar de ello, aún existe un gran desconocimiento sobre cuáles son los
microorganismos que poseen el potencial para degradar hidrocarburos en este ambiente. Esta
Tesis fue desarrollada con el objetivo de incrementar nuestros conocimientos sobre las
poblaciones bacterianas ecológicamente relevantes para la biodegradación de hidrocarburos
aromáticos policíclicos (HAPs) en sedimentos costeros con un alto grado de exposición a la
contaminación con estos compuestos. Para ello, se empleó un enfoque multidisciplinario que
involucró la determinación de variables fisicoquímicas y ambientales de los sitios de estudio,
como así también la aplicación de distintas herramientas moleculares independientes del
cultivo de microorganismos, la mayoría de ellas diseñadas para este estudio.
La estructura y diversidad de las comunidades bacterianas que habitan los sedimentos
intermareales contaminados con hidrocarburos de las zonas norte-centro y sur de Patagonia
fue analizada en profundidad por medio de la pirosecuenciación de fragmentos del gen ARNr
16S bacterianos amplificados a partir de ADN purificado de los sedimentos. Este análisis nos
permitió además estimar la diversidad y abundancia relativa de las poblaciones bacterianas de
estos ambientes que podrían presentar el potencial para degradar hidrocarburos. Por otro lado,
los genes que codifican enzimas dioxigenasas de HAPs, las cuales participan en el primer
paso de la degradación aeróbica de estos compuestos, fueron utilizados como marcadores
funcionales. La abundancia relativa de siete variantes de estos genes en sedimentos de las
zonas norte-centro y sur de Patagonia se cuantificó por PCR cuantitativa (qPCR), lo cual nos
permitió evaluar la relevancia ecológica de las poblaciones que llevan estos genes y su
distribución biogeográfica. Los genes de oxigenasas B, C y D, variantes recientemente
identificadas en sedimentos de Bahía Ushuaia, se encontraron en altas abundancias a lo largo
de seis años de muestreo en los sedimentos subantárticos, sugiriendo que las bacterias que
portan estos genes probablemente presenten un rol clave en la biodegradación de HAPs en
este ambiente marino. Además, los genes phnA1, identificados en Cycloclasticus spp., se
detectaron en nueve de las once muestras analizadas pertenecientes a dos regiones
biogeográficas, y su abundancia se vio positivamente correlacionada con la concentración de
fenantreno, HAPs de tres anillos y HAPs de bajo peso molecular. Estos resultados sugirieren
que bacterias del género Cycloclasticus podrían presentar un rol importante en la biodegradación de HAPs de bajo peso molecular en sedimentos de la costa Patagónica. Finalmente, se detectaron 14 variantes novedosas de genes de oxigenasas en los sedimentos de Bahía Ushuaia, utilizando cebadores diseñados en base a secuencias de genes de dioxigenasas de bacterias Gram-positivas.biodegradación de HAPs de bajo peso molecular en sedimentos de la costa Patagónica. Finalmente, se detectaron 14 variantes novedosas de genes de oxigenasas en los sedimentos de Bahía Ushuaia, utilizando cebadores diseñados en base a secuencias de genes de dioxigenasas de bacterias Gram-positivas. Los resultados obtenidos en esta Tesis muestran la existencia de una diversidad de poblaciones bacterianas con capacidad para degradar HAPs en sedimentos de la costa Patagónica, en particular en sedimentos Subantárticos, y sugieren la existencia de genes de dioxigenasas aún no identificados. Se observaron importantes diferencias en las abundancias de dichas poblaciones microbianas, tanto en el tiempo como en el espacio. |
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Dionisi, Hebe M. |
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Dionisi, Hebe M. Marcos, Magalí S. |
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