Uma heurística GRASP para o Problema da Sequência mais Próxima

O Problema da Sequência mais Próxima (PSMP) é um problema da Biologia Molecular que aparece no contexto da comparação de sequências. O objetivo é encontrar uma sequência que apresente a menor distância entre todas as sequências de um conjunto dado. O problema foi provado ser NP-difícil. Diversos al...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Laux, Válber, Lyra, Adria
Formato: Objeto de conferencia
Lenguaje:Portugués
Publicado: 2013
Materias:
Ciencias Informáticas
Bioinformática
Meta-heurísticas
GRASP
Problema da Sequência Mais Próxima
Acceso en línea:http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/94589
Aporte de:
SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata
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Problema da Sequência Mais Próxima
description O Problema da Sequência mais Próxima (PSMP) é um problema da Biologia Molecular que aparece no contexto da comparação de sequências. O objetivo é encontrar uma sequência que apresente a menor distância entre todas as sequências de um conjunto dado. O problema foi provado ser NP-difícil. Diversos algoritmos aproximativos, exatos e heurísticos tem sido propostos. Neste trabalho é proposto um algoritmo para o PSMP baseado na metaheurística GRASP, que apresentou soluções de boa qualidade em baixo tempo de execução nos testes realizados.
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