Herramienta de código abierto para la construcción automática de cariogramas

En este trabajo se presenta una herramienta de código abierto -según nuestro conocimiento, no existente hasta el momento- para automatizar la construcción del cariograma a partir de imágenes segmentadas de cromosomas en metafase. La solución se edifica en base a técnicas de visión computacional y ap...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Vizzarri, Cristian, Martínez, César E., Gerard, Matías
Formato: Objeto de conferencia Resumen
Lenguaje:Español
Publicado: 2018
Materias:
Ciencias Informáticas
cariograma
código abierto
Acceso en línea:http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/71201
http://47jaiio.sadio.org.ar/sites/default/files/cais-5.pdf
Aporte de:
SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata
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description En este trabajo se presenta una herramienta de código abierto -según nuestro conocimiento, no existente hasta el momento- para automatizar la construcción del cariograma a partir de imágenes segmentadas de cromosomas en metafase. La solución se edifica en base a técnicas de visión computacional y aprendizaje automático, investigando sobre ellas y su aplicabilidad. La parte lógica ( back-end ) de la herramienta está compuesta por dos arquitecturas de redes neuronales de última generación: una red neuronal convolucional dedicada a la caracterización de los cromosomas mediante extracción de características sobre las imágenes y un clasificador posterior basado en máquinas de aprendizaje extremo. La codificación del sistema base se realizó en Python y librerías relacionadas empleadas para el preprocesado de las imágenes y construcción de los modelos neuronales. La interfaz gráfica de usuario ( front-end ) que muestra por pantalla la información resultante fue desarrollada empleando el framework Electron.js , el cual que permite desarrollar aplicaciones de escritorio usando tecnologías web (HTML, CSS y JavaScript).
format Objeto de conferencia
Resumen
author Vizzarri, Cristian
Martínez, César E.
Gerard, Matías
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