Aplicación web para convertir archivos a un formato compatible entre diferentes softwares de análisis de redes biológicas

Se presenta una aplicación Web de acceso libre destinado a lacomunidad científica. Su objetivo es compatibilizar formatos de diversos software utilizados en el análisis de redes biológicas (redes génicas, regulatorias, de señales, y/o metabólicas). La aplicación web transforma los archivos con sinta...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales:	García, María D., Guebel, Daniel V.
Formato:	Objeto de conferencia
Lenguaje:	Español
Publicado:	2014
Materias:	Ciencias Informáticas systems biology Boolean logic multivalued logic network analysis software compatibility incidence matrix
Acceso en línea:	http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/41772 http://43jaiio.sadio.org.ar/proceedings/AST/Paper12_AST_Garcia.pdf
Aporte de:	SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata

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description	Se presenta una aplicación Web de acceso libre destinado a lacomunidad científica. Su objetivo es compatibilizar formatos de diversos software utilizados en el análisis de redes biológicas (redes génicas, regulatorias, de señales, y/o metabólicas). La aplicación web transforma los archivos con sintaxis tipo CellNetAnalyzer a otros formatos aptos para los programas Cytoscape, Binom, Diva,y MFinder. Ello permite así potenciar las prestaciones obtenibles de cada software. Además, la aplicación web también computa la matriz de incidencia, siendo ésta un insumo para la posterior determinación de la estructura modular del sistema. La aplicación web desarrollada tiene múltiples ventajas: (a) cubre una necesidad previamente insatisfecha; (b) permite el ingreso y procesamiento de datos de redes de gran tamaño evitando el ingreso individual de datos a través de interfaces gráficas; (c) no se requiere de ningún conocimiento de programación para su utilización; (d) el debugging incorporado localiza y facilita la corrección de errores en el archivo fuente. En conclusión, más investigadores podrán aplicar las herramientas del análisis de redes en los campos de biomedicina y biotecnología, así como su enseñanza en el ámbito universitario. La aplicación web se encuentra accesible para ser utilizada online en la dirección www.desarrollosdg.com.ar/Guebel/archivo1.php
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