Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos
Los antagonistas del receptor de histamina H3 (RH3) emergen como potenciales fármacos para diversos trastornos neurológicos como Alzheimer o Parkinson, además de su reciente evaluación en el cáncer de mama triple negativo. En este contexto, identificar nuevos ligandos antagonistas del RH3 es de gran...
Guardado en:
| Autores principales: | , , , , , |
|---|---|
| Formato: | Objeto de conferencia |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2024
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/177172 |
| Aporte de: |
| id |
I19-R120-10915-177172 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
I19-R120-10915-1771722025-03-07T20:07:01Z http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/177172 Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos Benitez, Carlos Marcelo Represa, Natacha Soledad Di Pasquale, Ricardo Comba, María Betina Medina, Vanina Zanardi, María Marta 2024-08 2024 2025-03-07T16:29:27Z es Ciencias Informáticas machine learning receptor histamina RH3 cribado virtual Los antagonistas del receptor de histamina H3 (RH3) emergen como potenciales fármacos para diversos trastornos neurológicos como Alzheimer o Parkinson, además de su reciente evaluación en el cáncer de mama triple negativo. En este contexto, identificar nuevos ligandos antagonistas del RH3 es de gran interés por su amplio espectro de aplicaciones. Este estudio emplea técnicas de machine learning, específicamente, de regresión con el algoritmo Gradient Boosting (XGBoost), para predecir la afinidad de compuestos orgánicos antagonistas por el RH3 (pKi) utilizando descriptores moleculares. Se recopiló una base de datos con 831 compuestos antagonistas con valores de pKi conocidos, a partir de los cuales se generaron representaciones SMILES y se calcularon 1173 descriptores moleculares de baja dimensionalidad. La base se dividió en conjuntos de entrenamiento (665 registros) y testeo (166 registros). Se entrenaron y evaluaron 10 modelos diferentes, aplicando validación cruzada K-fold=5. El modelo más destacado alcanzó un MSE de 0.54 y un MAE de 0.50 en el conjunto de entrenamiento, y un MSE de 0.76 y un MAE de 0.53 en el conjunto de prueba, con un RMSE de 0.72 y 0.87, respectivamente. Este abordaje quimioinformático propone una metodología eficaz para el cribado virtual de potenciales ligandos antagonistas del RH3, acelerando el descubrimiento de nuevos compuestos terapéuticos. Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa Objeto de conferencia Objeto de conferencia http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) application/pdf 56-59 |
| institution |
Universidad Nacional de La Plata |
| institution_str |
I-19 |
| repository_str |
R-120 |
| collection |
SEDICI (UNLP) |
| language |
Español |
| topic |
Ciencias Informáticas machine learning receptor histamina RH3 cribado virtual |
| spellingShingle |
Ciencias Informáticas machine learning receptor histamina RH3 cribado virtual Benitez, Carlos Marcelo Represa, Natacha Soledad Di Pasquale, Ricardo Comba, María Betina Medina, Vanina Zanardi, María Marta Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| topic_facet |
Ciencias Informáticas machine learning receptor histamina RH3 cribado virtual |
| description |
Los antagonistas del receptor de histamina H3 (RH3) emergen como potenciales fármacos para diversos trastornos neurológicos como Alzheimer o Parkinson, además de su reciente evaluación en el cáncer de mama triple negativo. En este contexto, identificar nuevos ligandos antagonistas del RH3 es de gran interés por su amplio espectro de aplicaciones. Este estudio emplea técnicas de machine learning, específicamente, de regresión con el algoritmo Gradient Boosting (XGBoost), para predecir la afinidad de compuestos orgánicos antagonistas por el RH3 (pKi) utilizando descriptores moleculares. Se recopiló una base de datos con 831 compuestos antagonistas con valores de pKi conocidos, a partir de los cuales se generaron representaciones SMILES y se calcularon 1173 descriptores moleculares de baja dimensionalidad. La base se dividió en conjuntos de entrenamiento (665 registros) y testeo (166 registros). Se entrenaron y evaluaron 10 modelos diferentes, aplicando validación cruzada K-fold=5. El modelo más destacado alcanzó un MSE de 0.54 y un MAE de 0.50 en el conjunto de entrenamiento, y un MSE de 0.76 y un MAE de 0.53 en el conjunto de prueba, con un RMSE de 0.72 y 0.87, respectivamente. Este abordaje quimioinformático propone una metodología eficaz para el cribado virtual de potenciales ligandos antagonistas del RH3, acelerando el descubrimiento de nuevos compuestos terapéuticos. |
| format |
Objeto de conferencia Objeto de conferencia |
| author |
Benitez, Carlos Marcelo Represa, Natacha Soledad Di Pasquale, Ricardo Comba, María Betina Medina, Vanina Zanardi, María Marta |
| author_facet |
Benitez, Carlos Marcelo Represa, Natacha Soledad Di Pasquale, Ricardo Comba, María Betina Medina, Vanina Zanardi, María Marta |
| author_sort |
Benitez, Carlos Marcelo |
| title |
Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| title_short |
Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| title_full |
Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| title_fullStr |
Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| title_full_unstemmed |
Aplicación de Machine Learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina RH3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| title_sort |
aplicación de machine learning para la predicción de antagonistas del receptor de histamina rh3 como potenciales candidatos terapéuticos |
| publishDate |
2024 |
| url |
http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/177172 |
| work_keys_str_mv |
AT benitezcarlosmarcelo aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos AT represanatachasoledad aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos AT dipasqualericardo aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos AT combamariabetina aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos AT medinavanina aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos AT zanardimariamarta aplicaciondemachinelearningparalapredicciondeantagonistasdelreceptordehistaminarh3comopotencialescandidatosterapeuticos |
| _version_ |
1847925347046129664 |