Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo

La endogamia puede definirse como el apareamiento entre individuos emparentados. Su aumento puede provocar depresión endogámica, que es la disminución de la media fenotípica poblacional de varios caracteres, principalmente los reproductivos. En los últimos años, la utilización de información genómic...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autor principal: Teran, Ester Mercedes
Otros Autores: Demyda Peyrás, Sebastián
Formato: Tesis Tesis de doctorado
Lenguaje:Español
Publicado: 2024
Materias:
Ciencias Veterinarias
endogamia
ROH
calidad espermática
Acceso en línea:http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/164185
https://doi.org/10.35537/10915/164185
Aporte de:
SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata
id I19-R120-10915-164185
record_format dspace
spelling I19-R120-10915-1641852024-03-25T20:09:41Z http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/164185 https://doi.org/10.35537/10915/164185 Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo Teran, Ester Mercedes 2024-03-06 2024 2024-03-25T14:18:56Z Demyda Peyrás, Sebastián Goszczynski, Daniel Estanislao Corva, Pablo Forneris, Natalia Molina, Antonio es Ciencias Veterinarias endogamia ROH calidad espermática La endogamia puede definirse como el apareamiento entre individuos emparentados. Su aumento puede provocar depresión endogámica, que es la disminución de la media fenotípica poblacional de varios caracteres, principalmente los reproductivos. En los últimos años, la utilización de información genómica ha permitido estimar de forma más precisa el nivel de endogamia, mediante la identificación de segmentos homocigotos (runs of homozygosity, ROH) y, en base a ellos poder calcular un coeficiente de endogamia molecular (FROH). En esta tesis se caracterizó la abundancia y distribución de ROH en tres poblaciones bovinas, encontrándose variabilidad, y acumulación de ROH en ciertas regiones en dos razas, las cuales se asociaron con procesos de selección. Particularmente, se observó variabilidad de ROH entre individuos con similares coeficientes de endogamia basados en pedigrí. Además, se evaluó el efecto de la endogamia molecular global, cromosómica y por longitud, sobre la morfometría, motilidad y longevidad espermática, así como las regiones genómicas enriquecidas en ROH asociadas a dichos caracteres. Se encontró que una endogamia mayor a 0,125 provocaba un incremento de espermatozoides pequeños y alargados, y una hiperactivación temprana, la cual podría limitar la longevidad espermática. Las regiones significativamente enriquecidas en ROH incluyeron genes asociados con la espermatogénesis, motilidad, fisiología espermática y el desarrollo embrionario. Se evidenciaron diferentes niveles de depresión endogámica entre los distintos cromosomas, y un mayor efecto debido a ROH largos, originados recientemente. Finalmente, una combinación de ROH y análisis de asociación permitió identificar genes potencialmente involucrados en la longevidad espermática. En conclusión, el uso de FROH es más fiable e informativo que el F basado en pedigrí, y complementado con el análisis funcional es una metodología innovadora para el análisis de depresión endogámica en caracteres productivos. Esta tesis contribuye a aumentar el conocimiento sobre los efectos de la endogamia molecular en la calidad espermática del bovino. Doctor en Ciencias Veterinarias Universidad Nacional de La Plata Facultad de Ciencias Veterinarias Tesis Tesis de doctorado http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0) application/pdf
institution Universidad Nacional de La Plata
institution_str I-19
repository_str R-120
collection SEDICI (UNLP)
language Español
topic Ciencias Veterinarias
endogamia
ROH
calidad espermática
spellingShingle Ciencias Veterinarias
endogamia
ROH
calidad espermática
Teran, Ester Mercedes
Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
topic_facet Ciencias Veterinarias
endogamia
ROH
calidad espermática
description La endogamia puede definirse como el apareamiento entre individuos emparentados. Su aumento puede provocar depresión endogámica, que es la disminución de la media fenotípica poblacional de varios caracteres, principalmente los reproductivos. En los últimos años, la utilización de información genómica ha permitido estimar de forma más precisa el nivel de endogamia, mediante la identificación de segmentos homocigotos (runs of homozygosity, ROH) y, en base a ellos poder calcular un coeficiente de endogamia molecular (FROH). En esta tesis se caracterizó la abundancia y distribución de ROH en tres poblaciones bovinas, encontrándose variabilidad, y acumulación de ROH en ciertas regiones en dos razas, las cuales se asociaron con procesos de selección. Particularmente, se observó variabilidad de ROH entre individuos con similares coeficientes de endogamia basados en pedigrí. Además, se evaluó el efecto de la endogamia molecular global, cromosómica y por longitud, sobre la morfometría, motilidad y longevidad espermática, así como las regiones genómicas enriquecidas en ROH asociadas a dichos caracteres. Se encontró que una endogamia mayor a 0,125 provocaba un incremento de espermatozoides pequeños y alargados, y una hiperactivación temprana, la cual podría limitar la longevidad espermática. Las regiones significativamente enriquecidas en ROH incluyeron genes asociados con la espermatogénesis, motilidad, fisiología espermática y el desarrollo embrionario. Se evidenciaron diferentes niveles de depresión endogámica entre los distintos cromosomas, y un mayor efecto debido a ROH largos, originados recientemente. Finalmente, una combinación de ROH y análisis de asociación permitió identificar genes potencialmente involucrados en la longevidad espermática. En conclusión, el uso de FROH es más fiable e informativo que el F basado en pedigrí, y complementado con el análisis funcional es una metodología innovadora para el análisis de depresión endogámica en caracteres productivos. Esta tesis contribuye a aumentar el conocimiento sobre los efectos de la endogamia molecular en la calidad espermática del bovino.
author2 Demyda Peyrás, Sebastián
author_facet Demyda Peyrás, Sebastián
Teran, Ester Mercedes
format Tesis
Tesis de doctorado
author Teran, Ester Mercedes
author_sort Teran, Ester Mercedes
title Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
title_short Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
title_full Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
title_fullStr Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
title_full_unstemmed Evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
title_sort evaluación de los efectos de la endogamia en la calidad seminal bovina mediante el análisis de bloques de homocigosidad y estudios de asociación de genoma completo
publishDate 2024
url http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/164185
https://doi.org/10.35537/10915/164185
work_keys_str_mv AT teranestermercedes evaluaciondelosefectosdelaendogamiaenlacalidadseminalbovinamedianteelanalisisdebloquesdehomocigosidadyestudiosdeasociaciondegenomacompleto
_version_ 1807222741168816128

Ejemplares similares