Contraste ontológico: una herramienta para el análisis de experimentos de proteómica/genómica funcional
La identificación de la activación de funciones biológicas u otros fenómenos mediados por genes suele ser una tarea compleja y dificultosa. Los resultados dependen de las referencias de contraste y la manera en que son visualizados o proporcionados al investigador, para su análisis. Presentamos aquí...
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| Autores principales: | , , , , , , , , |
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| Formato: | Objeto de conferencia |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2011
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/129312 |
| Aporte de: |
| Sumario: | La identificación de la activación de funciones biológicas u otros fenómenos mediados por genes suele ser una tarea compleja y dificultosa. Los resultados dependen de las referencias de contraste y la manera en que son visualizados o proporcionados al investigador, para su análisis. Presentamos aquí, una herramienta para analizar y comparar, en forma simultánea, múltiples referencias de contraste mediante una interfaz de análisis simple, que identifica automáticamente los términos biológicos de interés; facilitando la exploración y descubrimiento, en experimentos genómicos/proteómicos funcionales.
La herramienta fue evaluada en un experimento de expresión diferencial de proteínas en progresión tumoral mediada por SPARC, permitiendo la identificación de vías metabólicas asociadas a ella tales como organización de filamentos intermedios del citoesqueleto y regulación positiva de migración de leucocitos entre otras. |
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