Contraste ontológico: una herramienta para el análisis de experimentos de proteómica/genómica funcional

La identificación de la activación de funciones biológicas u otros fenómenos mediados por genes suele ser una tarea compleja y dificultosa. Los resultados dependen de las referencias de contraste y la manera en que son visualizados o proporcionados al investigador, para su análisis. Presentamos aquí...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Fresno, C., Llera, A. S., Girotti, M. R., Valacco, M. P., López, J. A., Podhajcer, O. L., Balzarini, M. G., Prada, F., Fernández, E. A.
Formato: Objeto de conferencia
Lenguaje:Español
Publicado: 2011
Materias:
Ciencias Informáticas
Integración de datos
proteómica
genómica
Acceso en línea:http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/129312
Aporte de:
SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata
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description La identificación de la activación de funciones biológicas u otros fenómenos mediados por genes suele ser una tarea compleja y dificultosa. Los resultados dependen de las referencias de contraste y la manera en que son visualizados o proporcionados al investigador, para su análisis. Presentamos aquí, una herramienta para analizar y comparar, en forma simultánea, múltiples referencias de contraste mediante una interfaz de análisis simple, que identifica automáticamente los términos biológicos de interés; facilitando la exploración y descubrimiento, en experimentos genómicos/proteómicos funcionales. La herramienta fue evaluada en un experimento de expresión diferencial de proteínas en progresión tumoral mediada por SPARC, permitiendo la identificación de vías metabólicas asociadas a ella tales como organización de filamentos intermedios del citoesqueleto y regulación positiva de migración de leucocitos entre otras.
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