Diseño experimental aplicado al diseño de hibridación en chips multi-arreglo

Una iniciativa conjunta del Instituto de Biotecnología, CICVyA, INTA Castelar, Argentina y el Centro de Investigación Príncipe Felipe, Valencia, España, permitió el desarrollo de una matriz de alta densidad de oligonucleótidos (chip) para el girasol (Helianthus annuus),incluyendo aproximadamente 42K...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Di Rienzo, Julio A., Peluffo, Lucila, Blesa, David, Fernández, Paula, García, Francisco, Lía, Verónica, Príncipi, Darío, Ehrenbolger, Federico, Conesa, Ana, Dopazo, Joaquín, Paniego, Norma, Heinz, Ruth A.
Formato:	Objeto de conferencia
Lenguaje:	Español
Publicado:	2011
Materias:	Ciencias Informáticas Bioinformática Microarrays Genómica Funcional girasol Diseño de Experimentos
Acceso en línea:	http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/125987 https://40jaiio.sadio.org.ar/sites/default/files/T2011/CAI/1039.pdf
Aporte de:	SEDICI (UNLP) de Universidad Nacional de La Plata

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description	Una iniciativa conjunta del Instituto de Biotecnología, CICVyA, INTA Castelar, Argentina y el Centro de Investigación Príncipe Felipe, Valencia, España, permitió el desarrollo de una matriz de alta densidad de oligonucleótidos (chip) para el girasol (Helianthus annuus),incluyendo aproximadamente 42K unigenes. El propósito de esta iniciativa fue el análisis de los perfiles de expresión génica en respuesta a factores bióticos y abióticos. Estos estudios se llevan a cabo en una red de laboratorios financiados a través del proyecto ANPCyT PAE 37100, que representan los sectores públicos, gubernamentales y privados en la Argentina. La disponibilidad de este chip ha dado y dará origen una serie de proyectos de genómica funcional en girasol. El chip, basado en tecnología Agilent, cuenta con un diseño de cuatro micromatrices (arreglos) por 44 K sondas lo que permite hibridar simultáneamente cuatro muestras. La disponibilidad de cuatro arreglos por chip, representa una ventaja desde el punto de vista del diseño experimental, pero al mismo tiempo introduce una innovación que debe ser considerada tanto al momento del diseño de las hibridaciones como en el análisis estadístico posterior.
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Diseño experimental aplicado al diseño de hibridación en chips multi-arreglo

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