Alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos usando algoritmos genéticos

El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntaje...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Solanilla, Luis Felipe
Formato: article Artículo
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad Icesi 2006
Materias:
BIOINFORMÁTICA
ALGORITMOS GENÉTICOS
GENÓMICA
ALINEAMINETO DE MÚLTIPLES SECUENCIAS
FACULTAD DE INGENIERÍA
PRODUCCIÓN INTELECTUAL REGISTRADA - UNIVERSIDAD ICESI
SISTEMA & TELEMÁTICA
BIOINFORMATICS
GENETIC ALGORITHMS
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/10906/828
http://www.icesi.edu.co/revistas/index.php/sistemas_telematica/article/view/946
http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib/?infile=details.glu&loid=150228
http://biblioteca.clacso.edu.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=co/co-008&d=10906828oai
Aporte de:
Red de Bibliotecas Virtuales de Ciencias Sociales (CLACSO) de Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales
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GENETIC ALGORITHMS
description El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntajes se obtienen mediante el método de la suma de pares, en el cual se consideran todas las posibles combinaciones de aminoácidos en cada columna del alineamiento y se califican basándose en las puntuaciones de la matriz BLOSUM62.
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