Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana

Los micro-ARNs (miARN) son una clase de ARNs pequeños que participan activamente de procesos biológicos fundamentales tales como el desarrollo de los organismos y las respuestas a cambios ambientales. Su biogénesis es un proceso complejo que comienza con el procesamiento de precursores que no pos...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autor principal: Mascali, Florencia Carla
Otros Autores: Rasia, Rodolfo M.
Formato: masterThesis Tésis de Maestría publishedVersion Material Didáctico
Lenguaje:Español
Publicado: 2020
Materias:
Arabidopsis thaliana
DCL1
Proteínas
Análisis
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/2133/18981
http://hdl.handle.net/2133/18981
Aporte de:
Repositorio Hipermedial de la Universidad Nacional de Rosario (UNR) de Universidad Nacional de Rosario
id I15-R121-2133-18981
record_format dspace
institution Universidad Nacional de Rosario
institution_str I-15
repository_str R-121
collection Repositorio Hipermedial de la Universidad Nacional de Rosario (UNR)
language Español
orig_language_str_mv spa
topic Arabidopsis thaliana
DCL1
Proteínas
Análisis
spellingShingle Arabidopsis thaliana
DCL1
Proteínas
Análisis
Mascali, Florencia Carla
Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
topic_facet Arabidopsis thaliana
DCL1
Proteínas
Análisis
description Los micro-ARNs (miARN) son una clase de ARNs pequeños que participan activamente de procesos biológicos fundamentales tales como el desarrollo de los organismos y las respuestas a cambios ambientales. Su biogénesis es un proceso complejo que comienza con el procesamiento de precursores que no poseen secuencias en común. La información estructural de alta resolución sobre proteínas involucradas en el proceso es escasa. La endoribonucleasa DCL1 es la enzima más importante involucrada en el proceso en plantas; sin embargo, no se conoce en detalle su funcionamiento. El estudio estructural y funcional de proteínas multidominio como DCL1 requiere la expresión por separado de cada dominio. Conocer el plegamiento de la proteína en estudio permitiría realizar elecciones racionales en la definición de los límites de los constructos a expresar. Por todo esto se planteó en este trabajo hacer un análisis estructural in silico de la región Plataforma-PAZ de DCL1, que es esencial en la determinación del tamaño del producto. Para ello se comenzó generando una base de datos con secuencias de proteínas que tuvieran similitud con la homóloga humana DICER, la cual fue curada según parámetros de similitud. Luego se procedió a realizar una predicción de dominios, en base a los cuales se determinó una región de interés que fue extraída de cada una de las secuencias. Después de realizar un análisis de la identidad presente entre las mismas, se extrajo un subgrupo de secuencias el cual fue alineado. Se llevó a cabo la predicción de estructuras secundarias de algunas de las proteínas de interés y se comparó con la información presente en bibliografía. Se pudo observar que las predicciones tanto de dominios como de secuencias fueron muy buenas, correspondiéndose con lo esperado. Sin embargo el alineamiento no fue bueno, y esto puede deberse a la baja homología de secuencia presente entre las distintas proteínas. Finalmente se hizo un modelado estructural usando la información del alineamiento general y la estructura conocida de la homóloga humana.
author2 Rasia, Rodolfo M.
author_facet Rasia, Rodolfo M.
Mascali, Florencia Carla
format masterThesis
Tésis de Maestría
publishedVersion
Material Didáctico
author Mascali, Florencia Carla
author_sort Mascali, Florencia Carla
title Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
title_short Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
title_full Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
title_fullStr Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
title_full_unstemmed Análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de DCL1 de Arabidopsis thaliana
title_sort análisis y modelado estructural de los dominios catalíticos de dcl1 de arabidopsis thaliana
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/2133/18981
http://hdl.handle.net/2133/18981
work_keys_str_mv AT mascaliflorenciacarla analisisymodeladoestructuraldelosdominioscataliticosdedcl1dearabidopsisthaliana
bdutipo_str Repositorios
_version_ 1764820410008862721

Ejemplares similares