Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina
Antecedentes. El Bocavirus humano (HBoV) es un parvovirus descripto por primera vez en 2005, asociado a cuadros leves y graves de infección respiratoria aguda (IRA), una de las principales causas de morbimortalidad en la población infantil en todo el mundo. Al presente se han identificado 4 genotipo...
Autores principales: | , , , , , |
---|---|
Formato: | Artículo revista |
Lenguaje: | Español |
Publicado: |
Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología
2015
|
Materias: | |
Acceso en línea: | https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/12114 |
Aporte de: |
id |
I10-R327-article-12114 |
---|---|
record_format |
ojs |
spelling |
I10-R327-article-121142024-08-27T18:19:46Z Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina Cardozo Tomás, Agustina Ghietto, Lucía María Insfrán, Constanza Wasinger, Nicolás Sebasián Marchesi, Ariana Lucía Adamo, María Pilar HBoV1 genoma completo Argentina análisis de secuencia. Antecedentes. El Bocavirus humano (HBoV) es un parvovirus descripto por primera vez en 2005, asociado a cuadros leves y graves de infección respiratoria aguda (IRA), una de las principales causas de morbimortalidad en la población infantil en todo el mundo. Al presente se han identificado 4 genotipos, nombradas HBoV1 a 4, de los cuales el primero es el que se asocia a IRA con predominancia.Objetivo. Obtener el genoma completo de HBoV respiratorio aislado localmente.Métodos. Se diseñaron primers para fragmentos superpuestos del genoma completo de HBoV, empleando las herramientas informáticas ClustalW y NCBI Primer-Blast. Los fragmentos se amplificaron por PCR convencional y se secuenciaron mediante tecnología capilar BigDye Terminator. La edición de las secuencias y análisis filogenético se realizó con el programa MEGA v6.Resultados. Se obtuvo la secuencia genómica completa de HBoV1 cepa 307AR09, aislada de secreción respiratoria de paciente pediátrico con bronquiolitis. La misma fue depositada en la base de datos GenBank con número de acceso KJ634207. El análisis filogenético con secuencias genómicas completas de los 4 genotipos obtenidas en distintas regiones del mundo muestra similitud cercana al 100% con la secuencia original descubierta en Suecia (DQ000495), así como el agrupamiento de los 4 genotipos en 2 clusters de alta homología interna: HBoV1-HBoV3 y HBoV2-HBoV4.Conclusiones. Se aportan datos locales para futuros desarrollos tecnológicos destinados tanto a la investigación como al diseño de métodos diagnósticos para la práctica médica. Por otra parte, los resultados sustentan la propuesta de redistribución taxonómica de los 4 genotipos en 2 especies. Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología 2015-09-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/12114 10.31053/1853.0605.v72.n3.12114 Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba.; Vol. 72 No. 3 (2015); 161-169 Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba; Vol. 72 Núm. 3 (2015); 161-169 Revista da Faculdade de Ciências Médicas de Córdoba; v. 72 n. 3 (2015); 161-169 1853-0605 0014-6722 10.31053/1853.0605.v72.n3 spa https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/12114/13739 Derechos de autor 2015 Universidad Nacional de Córdoba https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 |
institution |
Universidad Nacional de Córdoba |
institution_str |
I-10 |
repository_str |
R-327 |
container_title_str |
Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba |
language |
Español |
format |
Artículo revista |
topic |
HBoV1 genoma completo Argentina análisis de secuencia. |
spellingShingle |
HBoV1 genoma completo Argentina análisis de secuencia. Cardozo Tomás, Agustina Ghietto, Lucía María Insfrán, Constanza Wasinger, Nicolás Sebasián Marchesi, Ariana Lucía Adamo, María Pilar Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
topic_facet |
HBoV1 genoma completo Argentina análisis de secuencia. |
author |
Cardozo Tomás, Agustina Ghietto, Lucía María Insfrán, Constanza Wasinger, Nicolás Sebasián Marchesi, Ariana Lucía Adamo, María Pilar |
author_facet |
Cardozo Tomás, Agustina Ghietto, Lucía María Insfrán, Constanza Wasinger, Nicolás Sebasián Marchesi, Ariana Lucía Adamo, María Pilar |
author_sort |
Cardozo Tomás, Agustina |
title |
Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
title_short |
Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
title_full |
Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
title_fullStr |
Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
title_full_unstemmed |
Primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de Bocavirus Humano 1 aislado en Argentina |
title_sort |
primer reporte de secuencia genómica completa y análisis filogenético de bocavirus humano 1 aislado en argentina |
description |
Antecedentes. El Bocavirus humano (HBoV) es un parvovirus descripto por primera vez en 2005, asociado a cuadros leves y graves de infección respiratoria aguda (IRA), una de las principales causas de morbimortalidad en la población infantil en todo el mundo. Al presente se han identificado 4 genotipos, nombradas HBoV1 a 4, de los cuales el primero es el que se asocia a IRA con predominancia.Objetivo. Obtener el genoma completo de HBoV respiratorio aislado localmente.Métodos. Se diseñaron primers para fragmentos superpuestos del genoma completo de HBoV, empleando las herramientas informáticas ClustalW y NCBI Primer-Blast. Los fragmentos se amplificaron por PCR convencional y se secuenciaron mediante tecnología capilar BigDye Terminator. La edición de las secuencias y análisis filogenético se realizó con el programa MEGA v6.Resultados. Se obtuvo la secuencia genómica completa de HBoV1 cepa 307AR09, aislada de secreción respiratoria de paciente pediátrico con bronquiolitis. La misma fue depositada en la base de datos GenBank con número de acceso KJ634207. El análisis filogenético con secuencias genómicas completas de los 4 genotipos obtenidas en distintas regiones del mundo muestra similitud cercana al 100% con la secuencia original descubierta en Suecia (DQ000495), así como el agrupamiento de los 4 genotipos en 2 clusters de alta homología interna: HBoV1-HBoV3 y HBoV2-HBoV4.Conclusiones. Se aportan datos locales para futuros desarrollos tecnológicos destinados tanto a la investigación como al diseño de métodos diagnósticos para la práctica médica. Por otra parte, los resultados sustentan la propuesta de redistribución taxonómica de los 4 genotipos en 2 especies. |
publisher |
Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología |
publishDate |
2015 |
url |
https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/12114 |
work_keys_str_mv |
AT cardozotomasagustina primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina AT ghiettoluciamaria primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina AT insfranconstanza primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina AT wasingernicolassebasian primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina AT marchesiarianalucia primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina AT adamomariapilar primerreportedesecuenciagenomicacompletayanalisisfilogeneticodebocavirushumano1aisladoenargentina |
first_indexed |
2024-09-03T20:58:01Z |
last_indexed |
2024-09-03T20:58:01Z |
_version_ |
1809209970406719488 |