Beyond genomic selection the animal model strikes back (one generation)!

Genome inheritance is by segments of DNA rather than by independent loci. We introduce the ancestral regression (AR) as a recursive system of simultaneous equations, with grandparental path coefficients as novel parameters. The information given by the pedigree in the AR is complementary with that...

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Otros Autores: Cantet, Rodolfo Juan Carlos, García Baccino, Carolina Andrea, Rogberg Muñoz, Andrés, Forneris, Natalia Soledad, Munilla Leguizamón, Sebastián
Formato: Artículo
Lenguaje:Inglés
Materias:
Acceso en línea:http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2017cantet.pdf
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Aporte de:Registro referencial: Solicitar el recurso aquí
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245 |a Beyond genomic selection  |b the animal model strikes back (one generation)! 
520 |a Genome inheritance is by segments of DNA rather than by independent loci. We introduce the ancestral regression (AR) as a recursive system of simultaneous equations, with grandparental path coefficients as novel parameters. The information given by the pedigree in the AR is complementary with that provided by a dense set of genomic markers, such that the resulting linear function of grandparental BV is uncorrelated to the average of parental BV in the absence of inbreeding. AR is then connected to segmental inheritance by a causal multivariate Gaussian density for BV. The resulting covariance structure (Σ) is Markovian, meaning that conditional on the BV of parents and grandparents, the BV of the animal is independent of everything else. Thus, an algorithm is presented to invert the resulting covariance structure, with a computing effort that is linear in the number of animals as in the case of the inverse additive relationship matrix. 
653 |a BREEDING VALUE 
653 |a CAUSAL INFERENCE 
653 |a GAUSSIAN MARKOV DENSITY 
653 |a GENOMIC DATA 
653 |a SEGMENTAL INHERITANCE 
700 1 |9 12817  |a Cantet, Rodolfo Juan Carlos  |u Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina e Instituto de Investigaciones en Producción Animal (INPA) UBACONICET, Buenos Aires, Argentina. rcantet@agro.uba.ar 
700 1 |9 33814  |a García Baccino, Carolina Andrea  |u Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina 
700 1 |9 37756  |a Rogberg Muñoz, Andrés  |u Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina e Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET), Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata (UNLP) – CONICET, La Plata, Provincia de Buenos Aires, Argentina 
700 1 |9 29153  |a Forneris, Natalia Soledad  |u Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina 
700 1 |9 13019  |a Munilla Leguizamón, Sebastián  |u Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina 
773 0 |t Journal of animal breeding and genetics  |w SECS000108  |g Vol.134, no.3 (2017), p.224-231 
856 |f 2017cantet  |i En Reservorio  |q application/pdf  |u http://ri.agro.uba.ar/files/intranet/articulo/2017cantet.pdf  |x ARTI201806 
856 |u https://www.wiley.com  |z LINK AL EDITOR 
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