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1

Thiol redox biochemistry: Insights from computer simulations

por Zeida, A.
Publicado 2014

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The extraordinary catalytic ability of peroxiredoxins: A combined experimental and QM/MM study on the fast thiol oxidation step

por Zeida, A.
Publicado 2014

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Mechanism of cysteine oxidation by peroxynitrite: An integrated experimental and theoretical study

por Zeida, A.
Publicado 2013

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Molecular basis of the mechanism of thiol oxidation by hydrogen peroxide in aqueous solution: Challenging the S N2 paradigm

por Zeida, A.
Publicado 2012

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5

Molecular Basis of Hydroperoxide Specificity in Peroxiredoxins: The Case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis

por Zeida, A.
Publicado 2015

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6

Theoretical investigation of the mechanism of nitroxyl decomposition in aqueous solution

por Bringas, M., Semelak, J., Zeida, A., Estrin, D.A.

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7

Thionitrous Acid/Thionitrite and Perthionitrite Intermediates in the “Crosstalk” of NO and H 2 S

por Marcolongo, J.P., Zeida, A., Slep, L.D., Olabe, J.A.

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8

A computational investigation of the reactions of tyrosyl, tryptophanyl, and cysteinyl radicals with nitric oxide and molecular oxygen

por Pedron, F.N., Bartesaghi, S., Estrin, D.A., Radi, R., Zeida, A.

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9

Mechanism of cysteine oxidation by peroxynitrite: An integrated experimental and theoretical study

por Zeida, A., González Lebrero, M.C., Radi, R., Trujillo, M., Estrin, D.A.

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10

Assessing the accuracy of the SIRAH force field to model DNA at coarse grain level

por Dans, P.D., Darré, L., Machado, M.R., Zeida, A., Brandner, A.F., Pantano, S.

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11

Improving efficiency in SMD simulations through a hybrid differential relaxation algorithm

por Ramírez, C.L., Zeida, A., Jara, G.E., Roitberg, A.E., Martí, M.A.

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12

Exploring the Catalytic Mechanism of Human Glutamine Synthetase by Computer Simulations

por Issoglio, F.M., Campolo, N., Zeida, A., Grune, T., Radi, R., Estrin, D.A., Bartesaghi, S.

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13

Nitrosodisulfide [S2NO]- (perthionitrite) is a true intermediate during the "cross-talk" of nitrosyl and sulfide

por Marcolongo, J.P., Morzan, U.N., Zeida, A., Scherlis, D.A., Olabe, J.A.

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14

Molecular basis of the mechanism of thiol oxidation by hydrogen peroxide in aqueous solution: Challenging the S N2 paradigm

por Zeida, A., Babbush, R., González Lebrero, M.C., Trujillo, M., Radi, R., Estrin, D.A.

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15

The extraordinary catalytic ability of peroxiredoxins: A combined experimental and QM/MM study on the fast thiol oxidation step

por Zeida, A., Reyes, A.M., Lebrero, M.C.G., Radi, R., Trujillo, M., Estrin, D.A.

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16

Thiol redox biochemistry: Insights from computer simulations

por Zeida, A., Guardia, C.M., Lichtig, P., Perissinotti, L.L., Defelipe, L.A., Turjanski, A., Radi, R., Trujillo, M., Estrin, D.A.

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17

Insights into the mechanism of the reaction between hydrogen sulfide and peroxynitrite

por Cuevasanta, E., Zeida, A., Carballal, S., Wedmann, R., Morzan, U.N., Trujillo, M., Radi, R., Estrin, D.A., Filipovic, M.R., Alvarez, B.

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18

Molecular Basis of Hydroperoxide Specificity in Peroxiredoxins: The Case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis

por Zeida, A., Reyes, A.M., Lichtig, P., Hugo, M., Vazquez, D.S., Santos, J., González Flecha, F.L., Radi, R., Estrin, D.A., Trujillo, M.

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19

Chemical reactivity and spectroscopy explored from QM/MM molecular dynamics simulations using the LIO code

por Marcolongo, J.P., Zeida, A., Semelak, J.A., Foglia, N.O., Morzan, U.N., Estrin, D.A., Lebrero, M.C.G., Scherlis, D.A.

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20

PrxQ B from Mycobacterium tuberculosis is a monomeric, thioredoxin-dependent and highly efficient fatty acid hydroperoxide reductase

por Reyes, A.M., Vazquez, D.S., Zeida, A., Hugo, M., Piñeyro, M.D., De Armas, M.I., Estrin, D., Radi, R., Santos, J., Trujillo, M.

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