La UNCo está distribuida entre las provincias de Neuquén y Río Negro con centro en la ciudad de Neuquén y dependencias en Choele Choel, Cinco Saltos, Cipolletti, General Roca, San Antonio Oeste, San Carlos de Bariloche, San Martín de los Andes, Viedma, Villa Regina y Zapala.
La Universidad cuenta con doce Facultades y sus dos asentamientos universitarios dependientes, una escuela superior y dos centros regionales dispersos en varias ciudades de las provincias argentinas de Neuquén, Río Negro y Chubut.
Posee 3 repositorios o revistas asociadas en BDU
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