Herramienta bioinformática para la identificación de secuencias de superantígenos
Los superantígenos (SAgs) son proteínas bacterianas o virales que tienen la capacidad de estimular al sistema inmunológico de modo no convencional, generando una respuesta exacerbada y descontrolada. La identificación de este tipo de proteínas se realizó, hasta ahora, a través de métodos que no se a...
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| Autor principal: | |
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| Otros Autores: | |
| Formato: | Tesis doctoral acceptedVersion |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
Universidad Nacional de General Sarmiento
2024
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://repositorio.ungs.edu.ar:8080/xmlui/handle/UNGS/1539 |
| Aporte de: |
| Sumario: | Los superantígenos (SAgs) son proteínas bacterianas o virales que tienen la capacidad de estimular al sistema inmunológico de modo no convencional, generando una respuesta exacerbada y descontrolada. La identificación de este tipo de proteínas se realizó, hasta ahora, a través de métodos que no se adaptan a la evolución permanente de las secuencias. En este trabajo de tesis se desarrolló un programa que permite identificar de forma unívoca secuencias putativas, a nivel de aminoácidos o residuos, de SAgs bacterianos. Este método se basó en la teoría de la información de Shannon, para calcular la cantidad de información contenida en cada columna de aminoácidos en un alineamiento múltiple con el objetivo de determinar los aminoácidos que tienen el máximo nivel de información, en esto último radica lo novedoso del mismo. Este programa, aquí desarrollado, permitió identificar residuos claves para la interacción de los SAgs con las moléculas del complejo mayor de Histocompatibilidad de clase II. Finalmente, se comprobó la eficacia del método identificando secuencias de SAgs de S. aureus y S. pyogenes en una base de datos de proteínas. |
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