Análisis de redes aplicado a dinámicas moleculares de tipo COARSE-GRAIN. Estudio de la relación entre oligomerización y señalización de los receptores de la familia del factor de necrosis tumoral

Las familias de ligandos TNF y sus receptores (TNFR) cumplen un rol vital en la regulación del sistema inmune. La función de estas proteínas de membrana esta regulada por la unión ligando-receptor, pero también por asociaciones entre proteínas del mismo tipo ligando-ligando o receptor-receptor, p...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Cometto Vincente, Franco
Formato: Tesis NonPeerReviewed
Lenguaje:Español
Publicado: 2021
Materias:
DR5
Acceso en línea:http://ricabib.cab.cnea.gov.ar/952/1/1Cometto.pdf
Aporte de:
Descripción
Sumario:Las familias de ligandos TNF y sus receptores (TNFR) cumplen un rol vital en la regulación del sistema inmune. La función de estas proteínas de membrana esta regulada por la unión ligando-receptor, pero también por asociaciones entre proteínas del mismo tipo ligando-ligando o receptor-receptor, proceso conocido como (homo-)oligomerización. Las propiedades estructurales de la oligomerización de los ligandos de la familia de TNF han sido ampliamente estudiadas. Distinto es el caso de los receptores de la familia de TNFR. Estos receptores se pueden oligoremizar al unirse a su ligando específico. Sin embargo, varios estudios han demostrado que existe oligomerización de los TNFR independiente de la unión a ligandos y que este proceso tiene consecuencias en la señalización celular. En el presente trabajo se desarrollaron herramientas para el estudio del rol de los dominios transmembrana en la oligomerización de miembros de la familia TNFR, el cual es un fenómeno importante en la activación y señalizacion libre de ligandos de dichos receptores. Para esto se utilizaron dinámicas moleculares de tipo Coarse-Grain (grano grueso), las cuales se analizaron con herramientas que se desarrollaron en el presente trabajo y se implementaron en el lenguaje de programación R.