Análisis de redes aplicado a dinámicas moleculares de tipo COARSE-GRAIN. Estudio de la relación entre oligomerización y señalización de los receptores de la familia del factor de necrosis tumoral
Las familias de ligandos TNF y sus receptores (TNFR) cumplen un rol vital en la regulación del sistema inmune. La función de estas proteínas de membrana esta regulada por la unión ligando-receptor, pero también por asociaciones entre proteínas del mismo tipo ligando-ligando o receptor-receptor, p...
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Autor principal: | |
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Formato: | Tesis NonPeerReviewed |
Lenguaje: | Español |
Publicado: |
2021
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Materias: | |
Acceso en línea: | http://ricabib.cab.cnea.gov.ar/952/1/1Cometto.pdf |
Aporte de: |
Sumario: | Las familias de ligandos TNF y sus receptores (TNFR) cumplen un rol vital
en la regulación del sistema inmune. La función de estas proteínas de membrana
esta regulada por la unión ligando-receptor, pero también por asociaciones entre
proteínas del mismo tipo ligando-ligando o receptor-receptor, proceso conocido como
(homo-)oligomerización. Las propiedades estructurales de la oligomerización de los
ligandos de la familia de TNF han sido ampliamente estudiadas. Distinto es el caso
de los receptores de la familia de TNFR. Estos receptores se pueden oligoremizar al
unirse a su ligando específico. Sin embargo, varios estudios han demostrado que existe
oligomerización de los TNFR independiente de la unión a ligandos y que este proceso
tiene consecuencias en la señalización celular.
En el presente trabajo se desarrollaron herramientas para el estudio del rol de los
dominios transmembrana en la oligomerización de miembros de la familia TNFR, el
cual es un fenómeno importante en la activación y señalizacion libre de ligandos de
dichos receptores. Para esto se utilizaron dinámicas moleculares de tipo Coarse-Grain
(grano grueso), las cuales se analizaron con herramientas que se desarrollaron en el
presente trabajo y se implementaron en el lenguaje de programación R. |
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