Evolucion biológica en el origen de la vida: transmisión de genes horizontal versus vertical.
Una de las teorías más aceptadas hoy en día sobre el origen de la vida y de la evolución biológica, basada en las ideas de C. R. Woese, indica que la vida comenzó con una comunidad de organismos microscópicos que tenían la capacidad, no sólo de replicarse, sino de intercambiar material genético e...
Guardado en:
| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | Tesis NonPeerReviewed |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2018
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://ricabib.cab.cnea.gov.ar/756/1/1Prado.pdf |
| Aporte de: |
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Instituto Balseiro |
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Repositorio Institucional Centro Atómico Bariloche e Instituto Balseiro (RICABIB) |
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Simulación biológica Biological evolution Evolución biológica Genes [Progenotes Trasformation Trasformación Biological simulation Simulación biológica] |
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Simulación biológica Biological evolution Evolución biológica Genes [Progenotes Trasformation Trasformación Biological simulation Simulación biológica] Prado , Ayelén Evolucion biológica en el origen de la vida: transmisión de genes horizontal versus vertical. |
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Una de las teorías más aceptadas hoy en día sobre el origen de la vida y de la
evolución biológica, basada en las ideas de C. R. Woese, indica que la vida comenzó
con una comunidad de organismos microscópicos que tenían la capacidad, no sólo de
replicarse, sino de intercambiar material genético entre individuos mediante la llamada
transmisión horizontal de genes (THG), que hoy se observa principalmente en algunos
tipos de bacterias. (Por contraposición, la transmisión de genes de padres a hijos se
llama vertical.) En esta tesis estudiamos y desarrollamos modelos matemáticos para la
evolución en condiciones de coexistencia de transmisión horizontal y vertical de genes.
El objetivo apunta a contribuir a entender cómo pudo haberse dado la transición que
llevó de una etapa de evolución biológica en el que primaba la THG, a una en la que
prima la transmisión vertical.
El modelo base considerado para la evolución de la población de progenotes incluye
los efectos de la reproducción asexual, las mutaciones puntuales y la THG. Analizamos
dos maneras diferentes de generar la dinámica evolutiva: una estocástica basada en el
algoritmo de Gillespie y una determinista. Estudiamos los cambios en la dinámica en
función de los distintos parámetros del sistema y de las reglas aplicadas para seleccionar
las conexiones de THG. Mediante el algoritmo de Gillespie vimos que, cuando la tasa de
THG es alta, el sistema es biestable, alternando periódicamente entre configuraciones de
alta y baja entropía. Esta biestabilidad no se observa con el modelo determinista, lo cual
sugiere que es producto de las
fluctuaciones, y resalta la relevancia de la estocasticidad.
El principal resultado obtenido, y verificado tanto en la dinámica estocástica como
en la determinista, indica que la THG puede contribuir a acelerar el proceso por el
cual emerge (sobrevive) una única especie predominante (la de mejor adaptación al
ambiente), con tal de que los genotipos mejor adaptados están poco predispuestos a
recibir material genético externo. |
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I25-R131-7562021-02-03T15:29:03Z Evolucion biológica en el origen de la vida: transmisión de genes horizontal versus vertical. Evolution in the origins of live: horizontal vesus vertical gene transfer. Prado , Ayelén Simulación biológica Biological evolution Evolución biológica Genes [Progenotes Trasformation Trasformación Biological simulation Simulación biológica] Una de las teorías más aceptadas hoy en día sobre el origen de la vida y de la evolución biológica, basada en las ideas de C. R. Woese, indica que la vida comenzó con una comunidad de organismos microscópicos que tenían la capacidad, no sólo de replicarse, sino de intercambiar material genético entre individuos mediante la llamada transmisión horizontal de genes (THG), que hoy se observa principalmente en algunos tipos de bacterias. (Por contraposición, la transmisión de genes de padres a hijos se llama vertical.) En esta tesis estudiamos y desarrollamos modelos matemáticos para la evolución en condiciones de coexistencia de transmisión horizontal y vertical de genes. El objetivo apunta a contribuir a entender cómo pudo haberse dado la transición que llevó de una etapa de evolución biológica en el que primaba la THG, a una en la que prima la transmisión vertical. El modelo base considerado para la evolución de la población de progenotes incluye los efectos de la reproducción asexual, las mutaciones puntuales y la THG. Analizamos dos maneras diferentes de generar la dinámica evolutiva: una estocástica basada en el algoritmo de Gillespie y una determinista. Estudiamos los cambios en la dinámica en función de los distintos parámetros del sistema y de las reglas aplicadas para seleccionar las conexiones de THG. Mediante el algoritmo de Gillespie vimos que, cuando la tasa de THG es alta, el sistema es biestable, alternando periódicamente entre configuraciones de alta y baja entropía. Esta biestabilidad no se observa con el modelo determinista, lo cual sugiere que es producto de las fluctuaciones, y resalta la relevancia de la estocasticidad. El principal resultado obtenido, y verificado tanto en la dinámica estocástica como en la determinista, indica que la THG puede contribuir a acelerar el proceso por el cual emerge (sobrevive) una única especie predominante (la de mejor adaptación al ambiente), con tal de que los genotipos mejor adaptados están poco predispuestos a recibir material genético externo. One of the most widely accepted theories on the origin of life and biological evolution is based on the ideas of C. R. Woose, and states that life began with a community of microscopic organisms which had both the ability of self-replication and the of exchanging genetic material between themselves by means of horizontal gene transfer (HGT). Nowadays HGT still takes place for some types of bacteria. By contraposition, the transfer of genetic material from parent to offspring is denoted vertical gene transfer. In this thesis, we have developed and studied a mathematical model for evolution in the case of coexistence of horizontal and vertical gene transfer, aiming to contribute to the understanding of the means by which the transition from a stage in evolution with rampant HGT to a stage of predominance of vertical gene transfer could have taken place. Our base model for the evolution of a community of progenotes includes the effects of asexual reproduction, point mutations and HGT. The dynamics of the system were analyzed in two ways: the rst, stochastic based on the Gillespie algorithm, and the other deterministic. We studied the change in the dynamics as a function of the system parameters and of the procedure used to select the HGT connections. Results obtained by the Gillespie algorithm showed that the system presents a bistabilty when HGT is frequent, transitioning periodically between high and low entropy congurations. The bistability was not obtained with the deterministic model, suggesting that it is due to stochastic fructuations. We also found that, if we consider that well adapted genotypes are little predisposed to receiving external genetic material, HGT accelerates the process by which the species best adapted to the environment emerges. 2018-12-12 Tesis NonPeerReviewed application/pdf http://ricabib.cab.cnea.gov.ar/756/1/1Prado.pdf es Prado , Ayelén (2018) Evolucion biológica en el origen de la vida: transmisión de genes horizontal versus vertical. / Evolution in the origins of live: horizontal vesus vertical gene transfer. Maestría en Ciencias Físicas, Universidad Nacional de Cuyo, Instituto Balseiro. http://ricabib.cab.cnea.gov.ar/756/ |