Alineamiento e integración de información basada en ontologías para biogeografía marina y biodiversidad
El objetivo principal de esta tesis es analizar los problemas que existen actualmente con el manejo integrado de información en las ciencias de la vida en general, y particularmente analizar que sucede con la Biodiversidad y la Oceanografía. La actual crisis mundial de la biodiversidad, debida, en...
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| Autor principal: | |
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| Otros Autores: | |
| Formato: | tesis doctoral |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2019
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://repositoriodigital.uns.edu.ar/handle/123456789/4711 |
| Aporte de: |
| Sumario: | El objetivo principal de esta tesis es analizar los problemas que existen actualmente con el manejo integrado de información en las ciencias de la vida
en general, y particularmente analizar que sucede con la Biodiversidad y
la Oceanografía. La actual crisis mundial de la biodiversidad, debida, entre
otras cosas, al calentamiento global, genera un profundo impacto en la distribución geográfica de las especies y las comunidades ecológicas. Esto provoca
un creciente interés entre los científicos para coordinar el uso compartido de
conjuntos de datos que ayuden a entender esta problemática global. En este
contexto, el paradigma de los Datos Vinculados (Linked Data en inglés)
ha emergido como un conjunto de buenas prácticas para conectar, compartir
y exponer datos y conocimiento, una parte central de este paradigma
son las ontologías, que permiten la definición de vocabularios compartidos y
modelos conceptuales que ayuden a integrar esta información. Estas consideraciones
proporcionan una fuerte motivación para formular un sistema que
tenga en cuenta las características geoespaciales que pueden brindar respuestas
a preguntas como las siguientes: (i) >Cómo podemos definir las regiones
espaciales para nuestros estudios? (ii) >Cómo se distribuyen las especies en
una determinada región? (iii) Dada una georeferencia particular, >a qué re-
gión geográfica pertenece? (iv) >Cómo relacionar las ocurrencias de especies
con variables ambientales dentro de una región especifica?.
En esta tesis se presenta el desarrollo de un sistema basado en ontologías
denominado BiGe-Onto [ZBF+19] para administrar información de los dominios
de Biodiversidad y Biogeografía marina. Este sistema está compuesto
por (i) Arquitectura; (ii) Modelo conceptual; (iii) Versión operacional OWL
2; y (iv) Conjunto de datos vinculados para su explotación a través de un
punto final SPARQL.
La evaluación de BiGe-Onto se realizo desde dos enfoques, el primero
de ellos consiste en validar la ontologíaa utilizando datos reales extraídos de
repositorios de Biodiversidad y Biogeografía marina para luego validar el
modelo conceptual propuesto utilizando preguntas de competencia. El segundo
enfoque tiene que ver con la validación mediante casos de estudio
definidos en conjunto con investigadores del Centro Científico Tecnológico
(CENPAT-CONICET) que trabajan realizando análisis de distribución
de especies. Finalmente la documentación de BiGe-Onto esta disponible
en línea en http://crowd.fi.uncoma.edu.ar/cenpat-gilia/bigeonto/ y
el conjunto de datos enlazados es accesible públicamente a través de DOI
10.5281/zenodo.3235548. |
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