Estudio bioinformático de las glutamato deshidrogenasas de alto peso molecular en Actinobacteria
Las glutamato deshidrogenasas (GDHs) son enzimas oligoméricas ubicuas que cumplen roles claves en la homeostasis de aminoácidos. La subfamilia de las glutamato deshidrogenasas de alto peso molecular (L-GDHs) incluye a las L-GDHs115, compuestas por monómeros de 115 kDa, y las L-GDHs180, compuestas...
Guardado en:
| Autor principal: | |
|---|---|
| Otros Autores: | |
| Formato: | bachelorThesis Tésis de Grado acceptedVersion |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
2022
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/2133/24823 http://hdl.handle.net/2133/24823 |
| Aporte de: |
| Sumario: | Las glutamato deshidrogenasas (GDHs) son enzimas oligoméricas ubicuas que
cumplen roles claves en la homeostasis de aminoácidos. La subfamilia de las glutamato
deshidrogenasas de alto peso molecular (L-GDHs) incluye a las L-GDHs115, compuestas
por monómeros de 115 kDa, y las L-GDHs180, compuestas por subunidades de 180 kDa.
Recientemente en nuestro laboratorio se resolvió la estructura 3D de la L-GDH180
micobacteriana (mL-GDH180), la primera disponible para una L-GDH. Se encontró que
mL-GDH180 adopta una organización cuaternaria única, radicalmente diferente a la de
enzimas relacionadas de bajo peso molecular. Los contactos entre las subunidades de
mL-GDH180 son provistos por un dominio C-terminal que adopta un nuevo plegamiento y
un segmento N-terminal flexible que incluye dominios posiblemente involucrados en el
monitoreo de señales metabólicas.
En este trabajo se identificaron 21 L-GDHs115 y 140 L-GDH180 en 247 genomas
completos y referenciados disponibles para Actinobacteria. Estas secuencias fueron
agrupadas en base a la conservación de la estructura primaria y se seleccionó un
conjunto de 13 L-GDHs representativas con las que se realizaron predicciones
estructurales. Estos cálculos se llevaron a cabo empleando algoritmos ab initio que
utilizan aprendizaje automático para inferir contactos entre residuos a partir de patrones
de co-evolución. En su conjunto, los resultados obtenidos señalan que, a pesar de la baja
conservación de las secuencias en las regiones N- y C-terminales de las L-GDHs, en
especies distantes se mantiene la estructura terciaria de los módulos que componen los
monómeros como también la ubicación de los residuos involucrados en la estabilización
de la estructura cuaternaria. En consecuencia, este trabajo contribuye a sustentar la
hipótesis de que las características estructurales encontradas para mL-GDH180
constituyen un tema común en la subfamilia de las L-GDHs. |
|---|