Guía para la construcción de modelos de asociación genómica
En este texto se describen modelos de asociación que permiten realizar GWAS en paneles de líneas diversas, aún cuando éstas se encuentran estructuradas genéticamente. Para evitar falsos descubrimientos de asociaciones se trabaja primero identificando la estructura genética subyacente en la pobl...
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| Autores principales: | , , , |
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| Formato: | book |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
Brujas
2021
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/11086/21857 |
| Aporte de: |
| Sumario: | En este texto se describen modelos de asociación que permiten
realizar GWAS en paneles de líneas diversas, aún
cuando éstas se encuentran estructuradas genéticamente.
Para evitar falsos descubrimientos de asociaciones se
trabaja primero identificando la estructura genética subyacente
en la población de mapeo y luego incorporando
la información de correlación entre líneas en los modelos.
Adicionalmente, se controla la inflación de la tasa de falsos
positivos debida a la inferencia simultánea o multiplicidad
de prueba estadísticas que deben realizarse en estudios de
asociación con muchos MM. Para facilitar el ajuste de estos
modelos se describe el nuevo menú de MA embebido
en el software para análisis de datos genéticos Info-Gen
(Balzarini y Di Rienzo, 2018) y códigos para implementar
cada uno de los procedimientos estadísticos descriptos,
tanto para el análisis de EGP como para MA, usando el
software R (www.R-org.com). En la última parte de este
documento se ilustra cómo trabajar directamente en Info-
Gen y cómo ejecutar scripts de R desde el intérprete de R
disponible en Info-Gen. |
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